More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2136 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
155 aa  313  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  92.05 
 
 
157 aa  283  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  90.73 
 
 
157 aa  280  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  90.73 
 
 
157 aa  278  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  69.93 
 
 
163 aa  227  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  69.54 
 
 
163 aa  225  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2314  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  72.6 
 
 
180 aa  223  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4331  (2Fe-2S)-binding domain protein  74.15 
 
 
172 aa  216  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0662  putative oxidoreductase alpha subunit  72.11 
 
 
172 aa  214  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704314  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4546  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  70.95 
 
 
167 aa  213  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.945817  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2424  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  70 
 
 
160 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2492  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  67.35 
 
 
157 aa  211  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4059  (2Fe-2S)-binding  70.07 
 
 
165 aa  209  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  68.75 
 
 
185 aa  207  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.771185  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3926  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  71.22 
 
 
180 aa  206  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4323  (2Fe-2S)-binding  66.89 
 
 
167 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3482  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.89 
 
 
167 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109016 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4043  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.89 
 
 
167 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281878  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0189  (2Fe-2S)-binding domain protein  67.33 
 
 
167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.87 
 
 
157 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2516  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  65.99 
 
 
176 aa  196  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.18 
 
 
155 aa  191  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.07 
 
 
178 aa  188  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1182  (2Fe-2S)-binding  56.38 
 
 
150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.46 
 
 
174 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3931  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.11 
 
 
195 aa  176  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0278463  normal  0.0911563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  56.76 
 
 
164 aa  176  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3138  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.17 
 
 
156 aa  175  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0236  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.14 
 
 
156 aa  174  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1668  (2Fe-2S)-binding protein  64.43 
 
 
196 aa  173  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0567984  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8450  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.17 
 
 
156 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.46 
 
 
163 aa  169  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.35 
 
 
166 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.35 
 
 
166 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  52.35 
 
 
166 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4957  ferredoxin/(2Fe-2S)-binding protein  56.39 
 
 
166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926998  normal  0.121589 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.41 
 
 
170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5602  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.42 
 
 
166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5819  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.42 
 
 
166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.33 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5704  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.7 
 
 
164 aa  160  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  51.33 
 
 
157 aa  157  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  51.35 
 
 
154 aa  157  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  47.62 
 
 
168 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02524  putative aldehyde dehydrogenase subunit III  45.03 
 
 
166 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.33 
 
 
153 aa  154  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  49.66 
 
 
152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.67 
 
 
188 aa  153  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.98 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  53.1 
 
 
152 aa  150  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0874  (2Fe-2S)-binding  51.72 
 
 
149 aa  150  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.267928  normal  0.0847123 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.3 
 
 
151 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  48.3 
 
 
151 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.97 
 
 
151 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.3 
 
 
154 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  48.3 
 
 
151 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.3 
 
 
151 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  47.3 
 
 
166 aa  149  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4125  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.41 
 
 
154 aa  148  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.97 
 
 
151 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3426  ferredoxin  49.32 
 
 
154 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  50.68 
 
 
155 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.97 
 
 
151 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  47.37 
 
 
163 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  48.97 
 
 
151 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2296  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.68 
 
 
151 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3606  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.64 
 
 
154 aa  147  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3950  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.3 
 
 
164 aa  147  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.0539481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.03 
 
 
171 aa  147  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  49.32 
 
 
151 aa  147  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  45.58 
 
 
155 aa  147  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.37 
 
 
161 aa  147  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.37 
 
 
161 aa  147  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0177  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.1 
 
 
152 aa  147  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0550651  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  50.68 
 
 
155 aa  146  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.98 
 
 
187 aa  146  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2112  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.68 
 
 
151 aa  146  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  48.23 
 
 
153 aa  146  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3621  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.03 
 
 
151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588972  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2473  ferredoxin  46.31 
 
 
151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411449  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.34 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2021  putative aldehyde dehydrogenase  47.59 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290531  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.66 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.34 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2767  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  46.9 
 
 
149 aa  144  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.67 
 
 
162 aa  144  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7868  putative aldehyde dehydrogenase  46.9 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2833  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.94 
 
 
151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120723  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1987  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.65 
 
 
155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249056 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  47.92 
 
 
450 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0273  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
157 aa  144  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  46.9 
 
 
151 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3679  (2Fe-2S)-binding  44.3 
 
 
165 aa  144  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1416  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.36 
 
 
154 aa  144  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3933  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.68 
 
 
159 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0782071  normal  0.326869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0594  (2Fe-2S)-binding  46.9 
 
 
152 aa  143  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98773  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3087  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.9 
 
 
157 aa  143  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.544744  normal  0.0177824 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1703  (2Fe-2S)-binding protein  49.32 
 
 
167 aa  143  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281289  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3827  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.94 
 
 
151 aa  143  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.21 
 
 
151 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>