More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_43780 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  100 
 
 
163 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  96.93 
 
 
163 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  69.87 
 
 
157 aa  237  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  69.87 
 
 
157 aa  236  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  68.59 
 
 
157 aa  234  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  69.54 
 
 
155 aa  225  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0662  putative oxidoreductase alpha subunit  68.67 
 
 
172 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704314  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2314  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  70.55 
 
 
180 aa  220  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4331  (2Fe-2S)-binding domain protein  69.33 
 
 
172 aa  219  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2516  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  67.74 
 
 
176 aa  216  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4546  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.01 
 
 
167 aa  214  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.945817  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2492  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.64 
 
 
157 aa  213  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.01 
 
 
185 aa  213  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.771185  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3482  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.41 
 
 
167 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2424  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  69.66 
 
 
160 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.45 
 
 
157 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4323  (2Fe-2S)-binding  64.78 
 
 
167 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4043  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.78 
 
 
167 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281878  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.64 
 
 
155 aa  210  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3926  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  71.13 
 
 
180 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4059  (2Fe-2S)-binding  62.58 
 
 
165 aa  204  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  62.09 
 
 
164 aa  203  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1182  (2Fe-2S)-binding  64.63 
 
 
150 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3138  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.18 
 
 
156 aa  196  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5704  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.24 
 
 
164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  62.59 
 
 
166 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.59 
 
 
166 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.59 
 
 
166 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.4 
 
 
178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0236  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.9 
 
 
156 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.14 
 
 
170 aa  191  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8450  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.9 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4957  ferredoxin/(2Fe-2S)-binding protein  59.86 
 
 
166 aa  186  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926998  normal  0.121589 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5602  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.22 
 
 
166 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0189  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.82 
 
 
167 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.55 
 
 
174 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5819  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.22 
 
 
166 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.27 
 
 
163 aa  184  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3931  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.89 
 
 
195 aa  183  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0278463  normal  0.0911563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1668  (2Fe-2S)-binding protein  63.09 
 
 
196 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0567984  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  56.46 
 
 
157 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  54.67 
 
 
155 aa  167  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  54.42 
 
 
154 aa  166  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  52.98 
 
 
155 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  50 
 
 
155 aa  166  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.59 
 
 
171 aa  164  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  52.32 
 
 
163 aa  164  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.37 
 
 
151 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2899  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.66 
 
 
155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0288309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  54.55 
 
 
153 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  51.97 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  47.33 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.97 
 
 
162 aa  161  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3147  hypothetical protein  50.33 
 
 
152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  51.66 
 
 
152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02524  putative aldehyde dehydrogenase subunit III  48.37 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269034  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  48.67 
 
 
151 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1692  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.08 
 
 
146 aa  159  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.814616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.01 
 
 
163 aa  159  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0896  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.65 
 
 
168 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.419158  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.97 
 
 
158 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.36 
 
 
161 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.32 
 
 
151 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  49.32 
 
 
151 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.32 
 
 
151 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1256  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.42 
 
 
153 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1231  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.42 
 
 
153 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
151 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  50 
 
 
151 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
151 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.67 
 
 
155 aa  158  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.74 
 
 
153 aa  157  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.32 
 
 
154 aa  158  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2198  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.66 
 
 
177 aa  157  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185555  hitchhiker  0.00320999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.3 
 
 
151 aa  157  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4170  ferredoxin  48.68 
 
 
170 aa  157  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373967  normal  0.177637 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4470  ferredoxin/oxidoreductase  52.74 
 
 
153 aa  157  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325176  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3298  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.47 
 
 
155 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  50.34 
 
 
154 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  47.97 
 
 
153 aa  156  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6324  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.32 
 
 
156 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.633542  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2767  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  48.3 
 
 
149 aa  156  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1159  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.94 
 
 
149 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3087  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
157 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.544744  normal  0.0177824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.33 
 
 
187 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3213  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.2 
 
 
155 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0594  (2Fe-2S)-binding  44.97 
 
 
152 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98773  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.77 
 
 
159 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  47.26 
 
 
153 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.32 
 
 
158 aa  154  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  51.01 
 
 
151 aa  154  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2882  putative oxidoreductase  48.68 
 
 
156 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0857  (2Fe-2S)-binding  51.37 
 
 
153 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1338  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.37 
 
 
153 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3426  ferredoxin  50.33 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2506  putative oxidoreductase, alpha subunit  41.38 
 
 
176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674684  normal  0.179187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2662  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  47.97 
 
 
152 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626504  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1831  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.03 
 
 
155 aa  154  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.672438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  47.68 
 
 
158 aa  154  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3606  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.28 
 
 
154 aa  153  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>