More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5505 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
170 aa  349  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  81.53 
 
 
166 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  81.53 
 
 
166 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  81.53 
 
 
166 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5704  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  84.52 
 
 
164 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5602  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  84.77 
 
 
166 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5819  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  84.77 
 
 
166 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4957  ferredoxin/(2Fe-2S)-binding protein  75.9 
 
 
166 aa  263  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926998  normal  0.121589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  70.07 
 
 
157 aa  220  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1182  (2Fe-2S)-binding  65.31 
 
 
150 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  61.07 
 
 
164 aa  202  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  60.14 
 
 
163 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  60.14 
 
 
163 aa  189  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.78 
 
 
155 aa  188  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2516  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  55.7 
 
 
176 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.05 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.11 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.05 
 
 
157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.05 
 
 
157 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.14 
 
 
185 aa  168  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.771185  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3482  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.9 
 
 
167 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2492  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.29 
 
 
157 aa  167  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.68 
 
 
151 aa  166  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  51.35 
 
 
155 aa  166  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4059  (2Fe-2S)-binding  51.95 
 
 
165 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4546  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.3 
 
 
167 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.945817  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4323  (2Fe-2S)-binding  52.26 
 
 
167 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4043  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.26 
 
 
167 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281878  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3138  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.67 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.38 
 
 
157 aa  165  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.41 
 
 
155 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2424  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  53.02 
 
 
160 aa  163  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3926  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.4 
 
 
180 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.68 
 
 
151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  52.03 
 
 
152 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2314  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.82 
 
 
180 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4331  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.34 
 
 
172 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  48.99 
 
 
168 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8450  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.67 
 
 
156 aa  158  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  50.96 
 
 
163 aa  157  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.66 
 
 
174 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0236  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.35 
 
 
156 aa  157  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0662  putative oxidoreductase alpha subunit  47.13 
 
 
172 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704314  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0896  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.2 
 
 
168 aa  155  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.419158  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4888  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.34 
 
 
155 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5480  (2Fe-2S)-binding  49.34 
 
 
155 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5382  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.34 
 
 
155 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0874  (2Fe-2S)-binding  51.35 
 
 
149 aa  153  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.267928  normal  0.0847123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1159  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.83 
 
 
149 aa  153  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1746  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  51.02 
 
 
153 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.446262  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3465  (2Fe-2S)-binding  46.94 
 
 
154 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1530  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  50.34 
 
 
153 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1154  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  50.34 
 
 
153 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0594  (2Fe-2S)-binding  46.31 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98773  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.54 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0086  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  50.34 
 
 
153 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1735  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.37 
 
 
157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2250  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  50.34 
 
 
153 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.34 
 
 
159 aa  151  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.31 
 
 
187 aa  151  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1007  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  50.34 
 
 
153 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408478  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0922  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  50.34 
 
 
153 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0189  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.68 
 
 
167 aa  151  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2280  (2Fe-2S)-binding protein  47.62 
 
 
154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.938299  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  48.03 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2506  putative oxidoreductase, alpha subunit  42.13 
 
 
176 aa  150  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674684  normal  0.179187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.32 
 
 
153 aa  150  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40180  putative oxidoreductase  48.98 
 
 
153 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948778  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  46.58 
 
 
153 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.66 
 
 
161 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1891  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  47.65 
 
 
152 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1703  (2Fe-2S)-binding protein  45.78 
 
 
167 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281289  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.66 
 
 
161 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.34 
 
 
155 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  46.98 
 
 
166 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0278  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  49.3 
 
 
181 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2662  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  46.31 
 
 
152 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626504  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  46.94 
 
 
154 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.47 
 
 
162 aa  148  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3128  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.86 
 
 
158 aa  148  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0546642 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3164  ferredoxin like protein  47.71 
 
 
152 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.758839  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.68 
 
 
163 aa  148  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3902  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.71 
 
 
152 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  48.3 
 
 
152 aa  147  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.66 
 
 
158 aa  147  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7868  putative aldehyde dehydrogenase  49.66 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4470  ferredoxin/oxidoreductase  51.37 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325176  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.37 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  48.03 
 
 
154 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  46.71 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  44.97 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3046  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.01 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3530  (2Fe-2S)-binding  49.66 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6606  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.34 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0063446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4836  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.66 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0863  (2Fe-2S)-binding protein  48.98 
 
 
153 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3679  (2Fe-2S)-binding  46.62 
 
 
165 aa  145  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1256  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.68 
 
 
153 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1231  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.68 
 
 
153 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4457  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.95 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>