More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3375 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
155 aa  320  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3138  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  69.03 
 
 
156 aa  227  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8450  (2Fe-2S)-binding domain protein  69.03 
 
 
156 aa  223  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0236  (2Fe-2S)-binding domain protein  67.1 
 
 
156 aa  221  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  63.64 
 
 
163 aa  210  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  63.4 
 
 
163 aa  206  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1182  (2Fe-2S)-binding  62 
 
 
150 aa  202  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.99 
 
 
157 aa  200  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.99 
 
 
157 aa  199  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.04 
 
 
157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4546  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.67 
 
 
167 aa  194  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.945817  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  60 
 
 
164 aa  194  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3482  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.93 
 
 
167 aa  193  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109016 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4323  (2Fe-2S)-binding  60.26 
 
 
167 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4043  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.26 
 
 
167 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281878  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.18 
 
 
155 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4957  ferredoxin/(2Fe-2S)-binding protein  56.76 
 
 
166 aa  189  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926998  normal  0.121589 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.46 
 
 
166 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  59.46 
 
 
166 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.46 
 
 
166 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5704  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.06 
 
 
164 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.78 
 
 
170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2516  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  60.67 
 
 
176 aa  187  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5819  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.46 
 
 
166 aa  187  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5602  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.46 
 
 
166 aa  187  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.89 
 
 
157 aa  184  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4059  (2Fe-2S)-binding  56.95 
 
 
165 aa  183  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.86 
 
 
178 aa  183  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2314  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.54 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0189  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.46 
 
 
167 aa  180  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4331  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.73 
 
 
172 aa  179  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2424  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  57.05 
 
 
160 aa  179  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.26 
 
 
174 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2492  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.1 
 
 
157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0662  putative oxidoreductase alpha subunit  57.72 
 
 
172 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704314  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  54.73 
 
 
157 aa  174  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.46 
 
 
185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.771185  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.06 
 
 
151 aa  168  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.34 
 
 
151 aa  168  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  55.03 
 
 
151 aa  168  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  52.7 
 
 
155 aa  168  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  55.03 
 
 
151 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.03 
 
 
151 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.03 
 
 
151 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  53.06 
 
 
151 aa  167  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3252  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.06 
 
 
151 aa  167  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256088  normal  0.660124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3926  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.34 
 
 
180 aa  167  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.36 
 
 
151 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  54.36 
 
 
151 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.36 
 
 
151 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  52.63 
 
 
163 aa  165  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.32 
 
 
151 aa  165  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2601  (2Fe-2S)-binding  53.38 
 
 
154 aa  163  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.346256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.38 
 
 
163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1668  (2Fe-2S)-binding protein  58.94 
 
 
196 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0567984  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  54.36 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3840  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.67 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.97 
 
 
153 aa  161  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  53.52 
 
 
153 aa  161  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.02 
 
 
151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  49.66 
 
 
166 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1692  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.04 
 
 
146 aa  160  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.814616 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7215  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.66 
 
 
153 aa  159  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.34 
 
 
188 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3827  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.68 
 
 
151 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  46.67 
 
 
168 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4295  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
151 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2198  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
177 aa  158  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185555  hitchhiker  0.00320999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.14 
 
 
146 aa  157  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  52.35 
 
 
151 aa  157  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3426  ferredoxin  51.01 
 
 
154 aa  157  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1154  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  50.66 
 
 
153 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0086  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  50.66 
 
 
153 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1530  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  50.66 
 
 
153 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0922  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  50.66 
 
 
153 aa  157  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2250  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  50.66 
 
 
153 aa  157  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  52.03 
 
 
152 aa  157  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1007  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  50.66 
 
 
153 aa  157  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408478  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1746  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  50.66 
 
 
153 aa  156  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.446262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  51.01 
 
 
154 aa  156  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  48.65 
 
 
152 aa  156  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.99 
 
 
187 aa  156  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2899  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.99 
 
 
155 aa  156  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0288309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  48.68 
 
 
158 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3046  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.01 
 
 
155 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40180  putative oxidoreductase  50 
 
 
153 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948778  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4893  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.33 
 
 
148 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.65 
 
 
163 aa  154  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4569  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
155 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0863  (2Fe-2S)-binding protein  50 
 
 
153 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.38 
 
 
146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0838259  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.32 
 
 
153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3868  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505784  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  46.98 
 
 
153 aa  153  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.99 
 
 
159 aa  153  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.72 
 
 
171 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  52.35 
 
 
155 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2091  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.52 
 
 
155 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.512796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6606  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.33 
 
 
159 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0063446  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3758  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.71 
 
 
153 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  0.0134234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>