More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2447 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  100 
 
 
157 aa  323  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5602  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  70.75 
 
 
166 aa  224  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5819  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  70.75 
 
 
166 aa  224  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5704  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  69.08 
 
 
164 aa  222  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  69.39 
 
 
166 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  69.39 
 
 
166 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  69.39 
 
 
166 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  70.07 
 
 
170 aa  220  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4957  ferredoxin/(2Fe-2S)-binding protein  66.67 
 
 
166 aa  213  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926998  normal  0.121589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  60.84 
 
 
164 aa  191  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1182  (2Fe-2S)-binding  57.82 
 
 
150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  56.38 
 
 
163 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  56.46 
 
 
163 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3482  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.36 
 
 
167 aa  175  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4546  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.69 
 
 
167 aa  174  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.945817  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.73 
 
 
155 aa  174  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4323  (2Fe-2S)-binding  53.69 
 
 
167 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4043  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.69 
 
 
167 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281878  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.36 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.36 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0662  putative oxidoreductase alpha subunit  53.06 
 
 
172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704314  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.74 
 
 
178 aa  171  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4331  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.36 
 
 
172 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.26 
 
 
157 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8450  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.3 
 
 
156 aa  167  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2516  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  55.1 
 
 
176 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0236  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.33 
 
 
156 aa  165  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3138  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.32 
 
 
156 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2424  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  51.95 
 
 
160 aa  161  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2492  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.85 
 
 
157 aa  160  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4470  ferredoxin/oxidoreductase  52.6 
 
 
153 aa  160  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325176  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2314  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.75 
 
 
180 aa  158  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4059  (2Fe-2S)-binding  52.35 
 
 
165 aa  158  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1256  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.95 
 
 
153 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1231  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.95 
 
 
153 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  51.01 
 
 
155 aa  157  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.33 
 
 
155 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1317  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.95 
 
 
153 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0857  (2Fe-2S)-binding  51.95 
 
 
153 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1338  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.95 
 
 
153 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  47.26 
 
 
153 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.08 
 
 
185 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.771185  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.95 
 
 
153 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.68 
 
 
157 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3926  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.96 
 
 
180 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  51.02 
 
 
163 aa  154  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  45.81 
 
 
166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  50.68 
 
 
152 aa  153  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0896  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.67 
 
 
168 aa  153  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.419158  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.67 
 
 
163 aa  153  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.68 
 
 
188 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  50 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.97 
 
 
174 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0189  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.35 
 
 
167 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1159  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.21 
 
 
149 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  49.02 
 
 
152 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.34 
 
 
155 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4547  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.3 
 
 
152 aa  147  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.44 
 
 
151 aa  147  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.31 
 
 
187 aa  147  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2620  (2Fe-2S)-binding  44.97 
 
 
153 aa  147  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25850  Ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  49.66 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.589202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.62 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.94 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2882  putative oxidoreductase  46.53 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2730  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2425  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.4 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  46.26 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5382  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.26 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5480  (2Fe-2S)-binding  46.26 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4888  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.26 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33890  putative oxidoreductase  46.53 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.570354  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.48 
 
 
151 aa  144  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2823  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.33 
 
 
172 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0515601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1629  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.33 
 
 
172 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2747  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.33 
 
 
172 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  43.62 
 
 
151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.62 
 
 
151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  43.62 
 
 
151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.62 
 
 
151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1361  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.05 
 
 
174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4170  ferredoxin  46.85 
 
 
170 aa  144  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373967  normal  0.177637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  50 
 
 
153 aa  144  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.63 
 
 
158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.33 
 
 
161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.33 
 
 
161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  43.54 
 
 
153 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3049  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  47.02 
 
 
164 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2266  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.26 
 
 
168 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0955728 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3252  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.92 
 
 
151 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256088  normal  0.660124 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.44 
 
 
154 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3490  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  47.02 
 
 
153 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3465  (2Fe-2S)-binding  43.71 
 
 
154 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3840  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.51 
 
 
167 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.7 
 
 
163 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1439  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.1 
 
 
165 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  48.34 
 
 
155 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.28 
 
 
151 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.05 
 
 
153 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>