More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2266 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2266  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
168 aa  343  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0955728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2950  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  72.85 
 
 
157 aa  244  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3438  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  74.65 
 
 
151 aa  238  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1414  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  75 
 
 
150 aa  238  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0660371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2224  (2Fe-2S)-binding  74.32 
 
 
150 aa  236  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3049  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  71.03 
 
 
164 aa  230  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2425  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  74.1 
 
 
167 aa  230  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2730  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.91 
 
 
172 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2823  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.19 
 
 
172 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0515601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1629  (2Fe-2S)-binding domain protein  73.19 
 
 
172 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2747  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.19 
 
 
172 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1496  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.19 
 
 
165 aa  227  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1504  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.19 
 
 
165 aa  227  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1439  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.19 
 
 
165 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  67.35 
 
 
155 aa  205  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4170  ferredoxin  62.59 
 
 
170 aa  197  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373967  normal  0.177637 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7215  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.64 
 
 
153 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  58.33 
 
 
166 aa  192  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6606  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.6 
 
 
159 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0063446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.42 
 
 
157 aa  192  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4547  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.78 
 
 
152 aa  192  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.67 
 
 
162 aa  191  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.78 
 
 
159 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3490  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  56.46 
 
 
153 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.11 
 
 
158 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26060  oxidoreductase iron sulphur binding subunit  59.18 
 
 
152 aa  187  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.555573  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.82 
 
 
161 aa  187  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.82 
 
 
161 aa  187  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33890  putative oxidoreductase  58.5 
 
 
156 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.570354  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.62 
 
 
153 aa  187  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6069  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.77 
 
 
159 aa  187  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0922  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  60.27 
 
 
153 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2250  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  60.27 
 
 
153 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1007  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  60.27 
 
 
153 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408478  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1746  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  60.27 
 
 
153 aa  186  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.446262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2882  putative oxidoreductase  57.82 
 
 
156 aa  186  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3758  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.27 
 
 
153 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  0.0134234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3933  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.41 
 
 
159 aa  186  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0782071  normal  0.326869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  57.93 
 
 
156 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5448  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.59 
 
 
153 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0179621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0273  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.59 
 
 
157 aa  185  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0863  (2Fe-2S)-binding protein  58.9 
 
 
153 aa  185  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1416  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.53 
 
 
154 aa  185  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4836  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.59 
 
 
153 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3530  (2Fe-2S)-binding  59.59 
 
 
153 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25850  Ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  59.59 
 
 
156 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.589202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1317  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.93 
 
 
153 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.24 
 
 
163 aa  184  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0857  (2Fe-2S)-binding  57.93 
 
 
153 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1338  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.93 
 
 
153 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4470  ferredoxin/oxidoreductase  57.24 
 
 
153 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325176  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.59 
 
 
153 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211012  normal  0.305671 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1154  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  59.59 
 
 
153 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1530  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  59.59 
 
 
153 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.67 
 
 
187 aa  184  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  55.03 
 
 
154 aa  184  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0086  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  59.59 
 
 
153 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1987  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.43 
 
 
155 aa  184  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1256  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.24 
 
 
153 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1231  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.24 
 
 
153 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.74 
 
 
188 aa  184  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5972  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  58.22 
 
 
150 aa  184  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.59 
 
 
153 aa  183  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2920  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.85 
 
 
150 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4819  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.94 
 
 
151 aa  181  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5382  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.05 
 
 
155 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4888  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.05 
 
 
155 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5480  (2Fe-2S)-binding  57.05 
 
 
155 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0626  aldehyde dehydrogenase subunit III  57.14 
 
 
152 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.78 
 
 
154 aa  181  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3252  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.86 
 
 
151 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256088  normal  0.660124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  56.46 
 
 
151 aa  180  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.03 
 
 
163 aa  180  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6320  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.55 
 
 
157 aa  180  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  56.55 
 
 
151 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.55 
 
 
151 aa  179  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.55 
 
 
151 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1891  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  55.78 
 
 
152 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0913  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.67 
 
 
151 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3776  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.11 
 
 
152 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.76 
 
 
151 aa  179  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0874  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.67 
 
 
151 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  57.55 
 
 
153 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0849  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.85 
 
 
151 aa  178  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369182  normal  0.586703 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.74 
 
 
151 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.74 
 
 
151 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3950  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.38 
 
 
164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.0539481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2575  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.94 
 
 
151 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  53.74 
 
 
151 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  56.46 
 
 
155 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3557  (2Fe-2S)-binding  54.48 
 
 
152 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.608806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  53.06 
 
 
151 aa  177  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.06 
 
 
151 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.06 
 
 
151 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3840  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.63 
 
 
167 aa  176  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4483  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.05 
 
 
152 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  53.06 
 
 
151 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1750  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.64 
 
 
151 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.63 
 
 
155 aa  175  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4295  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.79 
 
 
151 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>