More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1317 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1317  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
153 aa  316  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0857  (2Fe-2S)-binding  99.35 
 
 
153 aa  315  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1338  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  99.35 
 
 
153 aa  315  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4470  ferredoxin/oxidoreductase  96.73 
 
 
153 aa  309  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325176  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1256  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  94.12 
 
 
153 aa  304  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1231  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  94.12 
 
 
153 aa  304  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  94.12 
 
 
153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6606  (2Fe-2S)-binding domain protein  73.29 
 
 
159 aa  231  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0063446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  73.97 
 
 
161 aa  230  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.97 
 
 
161 aa  230  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  73.29 
 
 
159 aa  229  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6069  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  70.55 
 
 
159 aa  224  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3933  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  72.6 
 
 
159 aa  225  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0782071  normal  0.326869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  69.48 
 
 
157 aa  220  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  66.89 
 
 
151 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3490  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  67.59 
 
 
153 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  64 
 
 
151 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  65.1 
 
 
151 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64 
 
 
151 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  64 
 
 
151 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64 
 
 
151 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.67 
 
 
151 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.67 
 
 
151 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  64.43 
 
 
151 aa  208  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  62.67 
 
 
151 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2620  (2Fe-2S)-binding  62.25 
 
 
153 aa  206  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  62.84 
 
 
168 aa  205  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3252  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.33 
 
 
151 aa  205  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256088  normal  0.660124 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.33 
 
 
151 aa  205  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4295  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.09 
 
 
151 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3827  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.42 
 
 
151 aa  204  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.01 
 
 
187 aa  204  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.29 
 
 
154 aa  203  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25850  Ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  63.33 
 
 
156 aa  202  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.589202  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.83 
 
 
158 aa  201  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2320  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.09 
 
 
152 aa  201  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0626  aldehyde dehydrogenase subunit III  63.33 
 
 
152 aa  201  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5382  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.99 
 
 
155 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4888  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.99 
 
 
155 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5480  (2Fe-2S)-binding  65.99 
 
 
155 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  60.78 
 
 
166 aa  200  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2882  putative oxidoreductase  61.9 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26060  oxidoreductase iron sulphur binding subunit  62.42 
 
 
152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.555573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.81 
 
 
151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33890  putative oxidoreductase  61.9 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.570354  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5972  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  62.33 
 
 
150 aa  198  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.96 
 
 
163 aa  197  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0273  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.33 
 
 
157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2662  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  61.07 
 
 
152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626504  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  64.75 
 
 
153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2920  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.01 
 
 
150 aa  194  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  60.26 
 
 
156 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.7 
 
 
163 aa  194  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  60.26 
 
 
154 aa  193  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7215  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.83 
 
 
153 aa  193  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1891  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  59.06 
 
 
152 aa  193  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4547  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.93 
 
 
152 aa  193  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0806  (2Fe-2S)-binding protein  60.4 
 
 
153 aa  193  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0756376  normal  0.191785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  59.18 
 
 
155 aa  192  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3557  (2Fe-2S)-binding  60 
 
 
152 aa  192  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.608806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4483  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.19 
 
 
152 aa  191  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1746  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  62.5 
 
 
153 aa  192  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.446262  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3147  hypothetical protein  61.49 
 
 
152 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2250  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  62.5 
 
 
153 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4170  ferredoxin  60.54 
 
 
170 aa  191  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373967  normal  0.177637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0068  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.93 
 
 
167 aa  191  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0863  (2Fe-2S)-binding protein  60 
 
 
153 aa  191  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1007  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  62.5 
 
 
153 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408478  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0922  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  62.5 
 
 
153 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.16 
 
 
171 aa  191  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  62.59 
 
 
153 aa  190  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60 
 
 
153 aa  190  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211012  normal  0.305671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.11 
 
 
153 aa  189  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4836  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60 
 
 
153 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3530  (2Fe-2S)-binding  60 
 
 
153 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0086  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  61.81 
 
 
153 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1530  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  61.81 
 
 
153 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1154  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  61.81 
 
 
153 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5448  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.33 
 
 
153 aa  188  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0179621 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  63.16 
 
 
155 aa  188  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.6 
 
 
188 aa  188  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0014  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.83 
 
 
151 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.652545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60 
 
 
153 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0018  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.38 
 
 
163 aa  187  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1414  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.54 
 
 
150 aa  187  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0660371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3426  ferredoxin  62.59 
 
 
154 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1750  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.16 
 
 
151 aa  187  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4569  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.52 
 
 
155 aa  186  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0594  (2Fe-2S)-binding  57.82 
 
 
152 aa  186  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98773  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40180  putative oxidoreductase  60.42 
 
 
153 aa  186  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948778  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3758  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.67 
 
 
153 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  0.0134234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0849  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.43 
 
 
151 aa  186  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369182  normal  0.586703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1987  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.38 
 
 
155 aa  186  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1629  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.05 
 
 
172 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403047 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3776  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.72 
 
 
152 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3087  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.27 
 
 
157 aa  186  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.544744  normal  0.0177824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.08 
 
 
151 aa  186  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  63.7 
 
 
163 aa  185  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2823  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.05 
 
 
172 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0515601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2266  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.93 
 
 
168 aa  185  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0955728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>