More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0236 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0236  (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8450  (2Fe-2S)-binding domain protein  84.62 
 
 
156 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3138  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  83.97 
 
 
156 aa  269  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  67.1 
 
 
155 aa  221  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  60.9 
 
 
163 aa  193  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  60.9 
 
 
163 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4546  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.93 
 
 
167 aa  189  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.945817  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.44 
 
 
157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2314  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.67 
 
 
180 aa  187  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0662  putative oxidoreductase alpha subunit  60.53 
 
 
172 aa  186  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704314  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4331  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.33 
 
 
172 aa  185  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.71 
 
 
157 aa  183  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3482  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.42 
 
 
167 aa  183  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.71 
 
 
157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4323  (2Fe-2S)-binding  57.42 
 
 
167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4043  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.42 
 
 
167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281878  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2492  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.11 
 
 
157 aa  180  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1182  (2Fe-2S)-binding  59.21 
 
 
150 aa  179  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.06 
 
 
157 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  61.49 
 
 
164 aa  178  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2516  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  59.73 
 
 
176 aa  177  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0189  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.72 
 
 
167 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.14 
 
 
155 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2424  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  58.67 
 
 
160 aa  174  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.63 
 
 
178 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.7 
 
 
174 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4059  (2Fe-2S)-binding  56.38 
 
 
165 aa  169  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  53.95 
 
 
152 aa  168  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2601  (2Fe-2S)-binding  55.48 
 
 
154 aa  167  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.346256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.36 
 
 
188 aa  167  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  57.24 
 
 
166 aa  166  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.24 
 
 
166 aa  166  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.24 
 
 
166 aa  166  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  53.33 
 
 
157 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2899  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.33 
 
 
155 aa  165  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0288309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  57.05 
 
 
152 aa  164  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  53.9 
 
 
163 aa  164  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5704  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.67 
 
 
164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4569  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.35 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.25 
 
 
161 aa  161  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.67 
 
 
159 aa  161  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5602  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.92 
 
 
166 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5819  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.92 
 
 
166 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.25 
 
 
161 aa  161  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3046  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.02 
 
 
155 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6606  (2Fe-2S)-binding domain protein  54 
 
 
159 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0063446  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.67 
 
 
162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  57.45 
 
 
153 aa  160  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4957  ferredoxin/(2Fe-2S)-binding protein  51.68 
 
 
166 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926998  normal  0.121589 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2662  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  51.66 
 
 
152 aa  158  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626504  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  49.34 
 
 
168 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6069  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54 
 
 
159 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.35 
 
 
170 aa  157  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  52.38 
 
 
153 aa  156  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  51.66 
 
 
154 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0594  (2Fe-2S)-binding  50 
 
 
152 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98773  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  52.94 
 
 
155 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  52.35 
 
 
151 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  56.95 
 
 
155 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3931  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.62 
 
 
195 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0278463  normal  0.0911563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3933  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.67 
 
 
159 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0782071  normal  0.326869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.68 
 
 
171 aa  155  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1668  (2Fe-2S)-binding protein  58.17 
 
 
196 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0567984  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.67 
 
 
151 aa  154  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  52 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.73 
 
 
185 aa  153  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.771185  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3147  hypothetical protein  50.66 
 
 
152 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2506  putative oxidoreductase, alpha subunit  45.61 
 
 
176 aa  153  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674684  normal  0.179187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.67 
 
 
153 aa  153  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  53.42 
 
 
156 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0018  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.65 
 
 
163 aa  152  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.97 
 
 
163 aa  152  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7215  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.33 
 
 
153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1530  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  48.7 
 
 
153 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1154  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  48.7 
 
 
153 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0086  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  48.7 
 
 
153 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1746  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  49.35 
 
 
153 aa  150  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.446262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.99 
 
 
151 aa  150  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3614  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.35 
 
 
164 aa  150  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.37 
 
 
187 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2250  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  48.7 
 
 
153 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0922  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  48.7 
 
 
153 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  47.97 
 
 
155 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1692  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.35 
 
 
146 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.814616 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1007  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  48.7 
 
 
153 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408478  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1831  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
155 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.672438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3926  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.86 
 
 
180 aa  148  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0863  (2Fe-2S)-binding protein  50.68 
 
 
153 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3950  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.02 
 
 
164 aa  148  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.0539481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3606  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.36 
 
 
154 aa  148  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3977  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.67 
 
 
153 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156195  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0068  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.02 
 
 
167 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  48 
 
 
154 aa  148  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  48.65 
 
 
166 aa  147  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3164  ferredoxin like protein  48.68 
 
 
152 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.758839  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3902  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.68 
 
 
152 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3087  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.32 
 
 
157 aa  147  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.544744  normal  0.0177824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3426  ferredoxin  48.32 
 
 
154 aa  147  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0896  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.08 
 
 
168 aa  147  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.419158  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6324  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.67 
 
 
156 aa  147  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.633542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>