More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4059 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4059  (2Fe-2S)-binding  100 
 
 
165 aa  329  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  69.13 
 
 
157 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  67.79 
 
 
157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  68.46 
 
 
157 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2314  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  68.87 
 
 
180 aa  210  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  70.07 
 
 
155 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0662  putative oxidoreductase alpha subunit  67.55 
 
 
172 aa  206  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704314  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2516  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  64.74 
 
 
176 aa  204  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4331  (2Fe-2S)-binding domain protein  67.1 
 
 
172 aa  204  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  64.9 
 
 
163 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  62.58 
 
 
163 aa  204  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0189  (2Fe-2S)-binding domain protein  71.94 
 
 
167 aa  200  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.1 
 
 
185 aa  199  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.771185  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4546  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.36 
 
 
167 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.945817  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2492  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.91 
 
 
157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3482  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.35 
 
 
167 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2424  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  64.47 
 
 
160 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4323  (2Fe-2S)-binding  61.73 
 
 
167 aa  193  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4043  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.73 
 
 
167 aa  193  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281878  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.9 
 
 
157 aa  192  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3926  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.77 
 
 
180 aa  187  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.95 
 
 
155 aa  183  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.06 
 
 
174 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  57.24 
 
 
164 aa  176  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1668  (2Fe-2S)-binding protein  61.54 
 
 
196 aa  173  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0567984  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.29 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  53.29 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.29 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4957  ferredoxin/(2Fe-2S)-binding protein  52.67 
 
 
166 aa  171  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926998  normal  0.121589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0236  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.38 
 
 
156 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5602  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.33 
 
 
166 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5819  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.33 
 
 
166 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.95 
 
 
170 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1182  (2Fe-2S)-binding  54.05 
 
 
150 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5704  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.63 
 
 
164 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3931  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.46 
 
 
195 aa  165  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0278463  normal  0.0911563 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8450  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.31 
 
 
156 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3138  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.54 
 
 
156 aa  163  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.06 
 
 
163 aa  160  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.7 
 
 
178 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  52.35 
 
 
157 aa  158  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  44.74 
 
 
168 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  51.02 
 
 
154 aa  155  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  45.1 
 
 
155 aa  154  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  48.32 
 
 
151 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.32 
 
 
151 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.98 
 
 
151 aa  152  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.32 
 
 
151 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  48.32 
 
 
151 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.99 
 
 
151 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.37 
 
 
187 aa  152  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  48.99 
 
 
151 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.99 
 
 
151 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  52.03 
 
 
152 aa  151  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1735  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.32 
 
 
157 aa  150  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  48.03 
 
 
152 aa  150  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.67 
 
 
154 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.3 
 
 
161 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2506  putative oxidoreductase, alpha subunit  40.94 
 
 
176 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674684  normal  0.179187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  51.77 
 
 
153 aa  148  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3827  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.32 
 
 
151 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0972  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.68 
 
 
160 aa  148  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0216815  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.32 
 
 
151 aa  148  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4295  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.65 
 
 
151 aa  147  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
158 aa  147  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0229  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.03 
 
 
181 aa  147  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903003  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  49.67 
 
 
151 aa  147  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  49.67 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0896  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.77 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.419158  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.66 
 
 
155 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4125  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.79 
 
 
154 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6206  putative xanthine dehydrogenase YagT-like, iron-sulfur binding subunit  50.68 
 
 
169 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2774  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  47.33 
 
 
158 aa  145  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.43 
 
 
171 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2899  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.32 
 
 
155 aa  144  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0288309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.59 
 
 
151 aa  144  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  46.2 
 
 
158 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3941  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.65 
 
 
181 aa  144  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3128  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.66 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0546642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  46.54 
 
 
155 aa  143  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.7 
 
 
157 aa  143  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1818  (2Fe-2S)-binding  44.81 
 
 
156 aa  143  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5382  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.39 
 
 
155 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.5 
 
 
162 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1692  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.03 
 
 
146 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.814616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4888  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.39 
 
 
155 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5480  (2Fe-2S)-binding  45.39 
 
 
155 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3426  ferredoxin  50 
 
 
154 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.97 
 
 
151 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.11 
 
 
164 aa  141  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.52 
 
 
185 aa  141  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4209  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.66 
 
 
182 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1527  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  48.3 
 
 
166 aa  141  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.496565  normal  0.655481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0645  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46.67 
 
 
158 aa  140  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  44.97 
 
 
151 aa  141  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.38 
 
 
151 aa  140  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.95 
 
 
161 aa  140  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.95 
 
 
161 aa  140  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.3 
 
 
158 aa  140  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2601  (2Fe-2S)-binding  47.26 
 
 
154 aa  140  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.346256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>