More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1729 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  308  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  64.86 
 
 
156 aa  204  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  63.01 
 
 
154 aa  201  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  59.86 
 
 
168 aa  201  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.78 
 
 
187 aa  193  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.9 
 
 
157 aa  193  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.27 
 
 
151 aa  193  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.69 
 
 
171 aa  192  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.11 
 
 
151 aa  190  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4547  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.46 
 
 
152 aa  189  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.64 
 
 
153 aa  189  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.14 
 
 
159 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  62.59 
 
 
152 aa  188  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.6 
 
 
162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.46 
 
 
161 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.46 
 
 
161 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  60.4 
 
 
155 aa  186  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.82 
 
 
163 aa  186  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6606  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.46 
 
 
159 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0063446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4470  ferredoxin/oxidoreductase  60.27 
 
 
153 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325176  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3614  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.33 
 
 
164 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2730  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.53 
 
 
172 aa  184  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.44 
 
 
188 aa  185  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  61.43 
 
 
153 aa  185  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.46 
 
 
163 aa  185  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1831  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.86 
 
 
155 aa  184  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.672438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  56.08 
 
 
155 aa  184  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1317  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.59 
 
 
153 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1256  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.27 
 
 
153 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1231  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.27 
 
 
153 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0857  (2Fe-2S)-binding  59.59 
 
 
153 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.59 
 
 
153 aa  184  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1338  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.59 
 
 
153 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  58.9 
 
 
155 aa  183  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2823  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.85 
 
 
172 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0515601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2747  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.85 
 
 
172 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1629  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.85 
 
 
172 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.96 
 
 
158 aa  183  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3426  ferredoxin  60.81 
 
 
154 aa  183  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.86 
 
 
159 aa  183  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  59.31 
 
 
152 aa  183  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2021  putative aldehyde dehydrogenase  58.78 
 
 
162 aa  183  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290531  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0641  Iron sulfer protein  60 
 
 
164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2425  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.85 
 
 
167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2601  (2Fe-2S)-binding  59.18 
 
 
154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.346256  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02524  putative aldehyde dehydrogenase subunit III  54.48 
 
 
166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269034  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  57.43 
 
 
151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7868  putative aldehyde dehydrogenase  59.31 
 
 
162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  54.67 
 
 
166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3490  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  58.9 
 
 
153 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3087  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.18 
 
 
157 aa  180  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.544744  normal  0.0177824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6069  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.43 
 
 
159 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3046  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58 
 
 
155 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4569  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.33 
 
 
155 aa  179  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2920  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.7 
 
 
150 aa  179  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1692  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.42 
 
 
146 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.814616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  55.41 
 
 
151 aa  178  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3147  hypothetical protein  55.78 
 
 
152 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2266  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.55 
 
 
168 aa  179  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0955728 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.41 
 
 
151 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  55.41 
 
 
151 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.41 
 
 
151 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0273  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.49 
 
 
157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0864  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.46 
 
 
152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.383234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0014  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.7 
 
 
151 aa  177  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.652545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  55.33 
 
 
151 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54 
 
 
155 aa  177  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3679  (2Fe-2S)-binding  56.16 
 
 
165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.24 
 
 
146 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847005  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.67 
 
 
151 aa  177  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.73 
 
 
151 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.73 
 
 
151 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  54.73 
 
 
151 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3049  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  55.41 
 
 
164 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0863  (2Fe-2S)-binding protein  53.02 
 
 
153 aa  176  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3933  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.41 
 
 
159 aa  176  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0782071  normal  0.326869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1439  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.48 
 
 
165 aa  176  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1496  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.48 
 
 
165 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3606  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.27 
 
 
154 aa  176  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3950  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.48 
 
 
164 aa  176  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.0539481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3868  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.85 
 
 
181 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505784  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7145  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.33 
 
 
175 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570626  normal  0.71892 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1504  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.48 
 
 
165 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3252  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.05 
 
 
151 aa  175  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256088  normal  0.660124 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.41 
 
 
151 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3827  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54 
 
 
151 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4295  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.33 
 
 
151 aa  174  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2091  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.97 
 
 
155 aa  174  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.512796 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.95 
 
 
154 aa  174  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5448  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.68 
 
 
153 aa  173  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0179621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33890  putative oxidoreductase  51.68 
 
 
156 aa  173  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.570354  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2882  putative oxidoreductase  51.68 
 
 
156 aa  173  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3164  ferredoxin like protein  55.1 
 
 
152 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.758839  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3902  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.1 
 
 
152 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3840  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.29 
 
 
167 aa  173  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3530  (2Fe-2S)-binding  51.68 
 
 
153 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4819  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.46 
 
 
151 aa  173  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4836  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.68 
 
 
153 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102836 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.86 
 
 
146 aa  173  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0838259  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2224  (2Fe-2S)-binding  54.23 
 
 
150 aa  173  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>