More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0864 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  100 
 
 
158 aa  328  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3128  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.58 
 
 
158 aa  205  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0546642 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.35 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  51.75 
 
 
154 aa  166  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0896  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.33 
 
 
168 aa  159  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.419158  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  47.65 
 
 
166 aa  159  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.68 
 
 
155 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.68 
 
 
157 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.58 
 
 
162 aa  154  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  47.68 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.02 
 
 
157 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2021  putative aldehyde dehydrogenase  46.58 
 
 
162 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290531  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  47.68 
 
 
163 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7868  putative aldehyde dehydrogenase  46.9 
 
 
162 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.36 
 
 
157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.03 
 
 
170 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.84 
 
 
178 aa  150  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.44 
 
 
154 aa  150  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.06 
 
 
161 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0416  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.71 
 
 
159 aa  148  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48 
 
 
166 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48 
 
 
166 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  48 
 
 
166 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.26 
 
 
187 aa  148  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3490  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  48.32 
 
 
153 aa  147  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  48.3 
 
 
155 aa  147  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  50 
 
 
164 aa  147  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3606  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.17 
 
 
154 aa  147  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1831  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.37 
 
 
155 aa  147  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.672438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.98 
 
 
146 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847005  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  47.62 
 
 
153 aa  147  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2899  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.26 
 
 
155 aa  146  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0288309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4957  ferredoxin/(2Fe-2S)-binding protein  46.75 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926998  normal  0.121589 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1735  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.52 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.31 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1182  (2Fe-2S)-binding  48.3 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4893  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.62 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3868  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.3 
 
 
181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505784  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4059  (2Fe-2S)-binding  47.33 
 
 
165 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  46.71 
 
 
152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  46.15 
 
 
158 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5819  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.36 
 
 
166 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5602  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.36 
 
 
166 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2184  (2Fe-2S)-binding domain protein  46 
 
 
160 aa  144  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.30857  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02524  putative aldehyde dehydrogenase subunit III  44.37 
 
 
166 aa  144  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  50.35 
 
 
161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.14 
 
 
151 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.34 
 
 
171 aa  144  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.62 
 
 
159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0237  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.7 
 
 
168 aa  143  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  52.41 
 
 
155 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2492  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.59 
 
 
157 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4457  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.52 
 
 
150 aa  142  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  50.33 
 
 
163 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1987  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.99 
 
 
155 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0236  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.75 
 
 
156 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.37 
 
 
155 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5704  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.62 
 
 
164 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.28 
 
 
158 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000354076  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  45.27 
 
 
168 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.97 
 
 
158 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.25 
 
 
188 aa  142  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0610  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.7 
 
 
170 aa  141  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.579224  normal  0.873609 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  46.41 
 
 
155 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3087  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.28 
 
 
157 aa  141  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.544744  normal  0.0177824 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4043  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.44 
 
 
167 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281878  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4323  (2Fe-2S)-binding  47.44 
 
 
167 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3679  (2Fe-2S)-binding  42.38 
 
 
165 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.62 
 
 
146 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0838259  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4331  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.15 
 
 
172 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.77 
 
 
174 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5972  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  46.94 
 
 
150 aa  141  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8450  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.81 
 
 
156 aa  141  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.03 
 
 
155 aa  141  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2266  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.33 
 
 
168 aa  140  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0955728 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2920  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.26 
 
 
150 aa  140  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  50.36 
 
 
153 aa  140  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  46.58 
 
 
156 aa  140  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2111  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.66 
 
 
146 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1037  (2Fe-2S)-binding  47.62 
 
 
179 aa  140  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.365772  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5382  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.94 
 
 
155 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4888  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.94 
 
 
155 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.23 
 
 
185 aa  140  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5480  (2Fe-2S)-binding  46.94 
 
 
155 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.58 
 
 
153 aa  140  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2091  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.41 
 
 
155 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.512796 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1768  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.68 
 
 
155 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3138  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.16 
 
 
156 aa  140  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2506  putative oxidoreductase, alpha subunit  40.94 
 
 
176 aa  140  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674684  normal  0.179187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3049  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  44.3 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2516  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  44.59 
 
 
176 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  46.67 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  46 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3482  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.79 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.9 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.771185  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2601  (2Fe-2S)-binding  44.3 
 
 
154 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.346256  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4546  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.44 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.945817  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  44.83 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2950  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.59 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1414  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.26 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0660371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>