More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2520 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2520  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
228 aa  460  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.746665  normal  0.752418 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0810  oxidoreductase, iron-sulfur subunit  52.15 
 
 
175 aa  175  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0953  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.15 
 
 
175 aa  175  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.749232  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0761  2Fe-2S protein  48.11 
 
 
205 aa  175  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2135  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  53.06 
 
 
171 aa  168  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2509  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.34 
 
 
164 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1766  (2Fe-2S)-binding  51.95 
 
 
161 aa  164  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0237  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.35 
 
 
168 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0916  twin-arginine translocation pathway signal  50.34 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0610  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.01 
 
 
170 aa  160  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.579224  normal  0.873609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1469  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  51.7 
 
 
175 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.167171 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2184  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.84 
 
 
160 aa  158  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.30857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2765  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.01 
 
 
165 aa  158  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00163035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2836  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.62 
 
 
171 aa  157  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1763  (2Fe-2S)-binding  50.33 
 
 
161 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.102431  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2660  putative carbon monoxide dehydrogenase  50.31 
 
 
162 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175738  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1039  (2Fe-2S)-binding  49.66 
 
 
168 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1354  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.34 
 
 
175 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.3 
 
 
185 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.77 
 
 
241 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2976  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
252 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.67 
 
 
259 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117621 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0100  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.13 
 
 
236 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8335  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.99 
 
 
211 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.733806  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.12 
 
 
219 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1418  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.68 
 
 
175 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274063  normal  0.518826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1379  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.67 
 
 
162 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.803188  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  46.59 
 
 
250 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0449  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.32 
 
 
163 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.583963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0843  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.5 
 
 
160 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1873  (2Fe-2S)-binding protein  48 
 
 
191 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0340  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.45 
 
 
163 aa  154  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4209  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.98 
 
 
182 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6206  putative xanthine dehydrogenase YagT-like, iron-sulfur binding subunit  47.71 
 
 
169 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2774  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4105  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.32 
 
 
168 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83677  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2878  putative carbon-monoxide dehydrogenase small chain  49.01 
 
 
160 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685063  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1524  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.01 
 
 
160 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.152044  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0972  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.66 
 
 
160 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0216815  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1735  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.98 
 
 
157 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0479  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.97 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0229  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.32 
 
 
181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903003  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.58 
 
 
161 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.73 
 
 
249 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2166  (2Fe-2S)-binding domain protein  39.58 
 
 
208 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2341  (2Fe-2S)-binding  48.73 
 
 
252 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2955  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.73 
 
 
252 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0333193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00245  predicted xanthine dehydrogenase, 2Fe-2S subunit  39.01 
 
 
229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00248  hypothetical protein  39.01 
 
 
229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  47.95 
 
 
155 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  41 
 
 
226 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1223  putative oxidoreductase  52.32 
 
 
183 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0332  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  38.57 
 
 
229 aa  151  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0297  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  39.01 
 
 
229 aa  151  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2157  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.81 
 
 
166 aa  151  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2864  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.37 
 
 
251 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0095  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.3 
 
 
166 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739421  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  49.01 
 
 
176 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1948  (2Fe-2S)-binding  48.98 
 
 
165 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.03276  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1142  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.01 
 
 
160 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.442126  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3001  ferredoxin  49.37 
 
 
251 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3318  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.57 
 
 
229 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2654  4Fe-4S binding domain protein  41 
 
 
225 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0493248  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0528  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.98 
 
 
171 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  39.13 
 
 
280 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.83 
 
 
154 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3040  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
165 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22503  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0527  twin-arginine translocation pathway signal  42.64 
 
 
227 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000232216  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0490  (2Fe-2S)-binding protein  44.3 
 
 
191 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2813  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
165 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.884029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0582  twin-arginine translocation pathway signal  42.21 
 
 
199 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0501  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.3 
 
 
191 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.671579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.45 
 
 
138 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0365  (2Fe-2S)-binding  49.32 
 
 
173 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.02 
 
 
164 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20090  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, small subunit CoxS/CutS-like protein  45.45 
 
 
159 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099649  hitchhiker  0.000822229 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3333  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  38.57 
 
 
229 aa  148  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0645  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  48.95 
 
 
158 aa  148  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2001  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.1 
 
 
166 aa  148  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2109  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  38.31 
 
 
213 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5132  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
183 aa  148  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.3 
 
 
158 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000354076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3970  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.99 
 
 
156 aa  148  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1211  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.45 
 
 
163 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.103278  normal  0.545927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4315  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.65 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2696  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.98 
 
 
164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0280354  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2931  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.01 
 
 
164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0748956  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3308  oxidoreductase, small subunit, putative  50.69 
 
 
175 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.0215353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0111  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.2 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2568  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.62 
 
 
160 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133715  hitchhiker  0.000000432495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4202  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.49 
 
 
240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4925  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.21 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.117712  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  41.75 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1748  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  46.06 
 
 
166 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.94 
 
 
154 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652402  normal  0.0357628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1361  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.39 
 
 
174 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4261  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.25 
 
 
191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.793616  normal  0.381135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0370  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.62 
 
 
172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4272  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.98 
 
 
167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  48.32 
 
 
163 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.34 
 
 
157 aa  145  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>