More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2773 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
158 aa  323  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000354076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.84 
 
 
161 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.38 
 
 
154 aa  186  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  62.24 
 
 
161 aa  184  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2152  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.24 
 
 
164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.98 
 
 
164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1513  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.05 
 
 
163 aa  171  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1735  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.29 
 
 
157 aa  170  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0431  selenium-dependent molybdenum hydroxylase 1  52.56 
 
 
855 aa  166  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1818  (2Fe-2S)-binding  49.33 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3075  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  53.06 
 
 
160 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2135  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  50.68 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0737  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  54.48 
 
 
163 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1673  selenium-dependent molybdenum hydroxylase 1  51.97 
 
 
858 aa  160  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0194  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.01 
 
 
154 aa  160  6e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  52.78 
 
 
161 aa  160  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  53.74 
 
 
158 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1323  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
151 aa  160  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  51.03 
 
 
153 aa  159  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.34 
 
 
157 aa  159  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  53.79 
 
 
163 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  53.1 
 
 
176 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  52.82 
 
 
450 aa  157  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4272  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.05 
 
 
167 aa  157  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4735  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.01 
 
 
157 aa  157  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854984  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2836  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.65 
 
 
171 aa  157  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
185 aa  157  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0843  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
160 aa  157  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152719 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2765  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.32 
 
 
165 aa  156  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00163035  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1497  selenium-dependent molybdenum hydroxylase 1  49.68 
 
 
853 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0340  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.65 
 
 
163 aa  155  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1948  (2Fe-2S)-binding  50.99 
 
 
165 aa  155  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.03276  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.32 
 
 
158 aa  155  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2414  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.03 
 
 
160 aa  155  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.55 
 
 
173 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0416  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.7 
 
 
159 aa  155  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4004  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.64 
 
 
161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213376  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5970  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.03 
 
 
184 aa  153  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452775  normal  0.916534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2540  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  52.03 
 
 
157 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0424992  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0645  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.35 
 
 
158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.33 
 
 
164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0209276  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1335  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  54.93 
 
 
160 aa  151  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1445  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.68 
 
 
158 aa  150  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  48.05 
 
 
154 aa  150  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2568  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.77 
 
 
160 aa  150  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133715  hitchhiker  0.000000432495 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2184  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.32 
 
 
160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.30857  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1873  (2Fe-2S)-binding protein  53.02 
 
 
191 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0528  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.67 
 
 
171 aa  150  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  50.35 
 
 
155 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3128  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.35 
 
 
158 aa  149  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0546642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0365  (2Fe-2S)-binding  51.02 
 
 
173 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0237  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.65 
 
 
168 aa  148  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2520  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.3 
 
 
228 aa  148  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.746665  normal  0.752418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2837  (2Fe-2S)-binding protein  50.34 
 
 
153 aa  148  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.126759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1361  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.26 
 
 
174 aa  147  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0610  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.99 
 
 
170 aa  147  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.579224  normal  0.873609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2011  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.79 
 
 
167 aa  146  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1039  (2Fe-2S)-binding  48.61 
 
 
168 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1469  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  49.3 
 
 
175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3103  (2Fe-2S)-binding protein  48.67 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101445  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2001  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.02 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3388  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.37 
 
 
156 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1354  (2Fe-2S)-binding domain protein  46 
 
 
175 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  48.99 
 
 
163 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1168  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
173 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0479  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.81 
 
 
191 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.34 
 
 
163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3112  (2Fe-2S)-binding protein  47.4 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153526  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1247  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  50 
 
 
914 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.265389  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0972  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.33 
 
 
160 aa  144  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0216815  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.16 
 
 
154 aa  144  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652402  normal  0.0357628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2775  hypothetical protein  50.35 
 
 
157 aa  144  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119286  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1999  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  48.3 
 
 
853 aa  144  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2145  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  48.7 
 
 
173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.691759  normal  0.106078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.7 
 
 
157 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2647  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.06 
 
 
162 aa  143  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5855  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.67 
 
 
175 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.32 
 
 
158 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2660  putative carbon monoxide dehydrogenase  50.33 
 
 
162 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175738  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  48.28 
 
 
158 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1379  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.37 
 
 
162 aa  142  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.803188  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4234  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.5 
 
 
173 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.71 
 
 
164 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2878  putative carbon-monoxide dehydrogenase small chain  48.99 
 
 
160 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3095  (2Fe-2S)-binding protein  46.31 
 
 
164 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2696  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.65 
 
 
164 aa  141  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0280354  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.03 
 
 
157 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0111  (2Fe-2S)-binding protein  45.7 
 
 
161 aa  141  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0551  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.92 
 
 
162 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1418  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.52 
 
 
175 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274063  normal  0.518826 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1524  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.99 
 
 
160 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.152044  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1563  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  45.39 
 
 
165 aa  141  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1527  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.65 
 
 
166 aa  140  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.496565  normal  0.655481 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3539  aldehyde dehydrogenase, molybdenum-binding subunit apoprotein  45.75 
 
 
907 aa  140  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.232426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.02 
 
 
151 aa  140  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50 
 
 
170 aa  140  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  46.88 
 
 
280 aa  140  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1766  (2Fe-2S)-binding  49.67 
 
 
161 aa  140  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0490  (2Fe-2S)-binding protein  44.16 
 
 
191 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0501  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.16 
 
 
191 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.671579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>