More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4953 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
260 aa  527  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  85.11 
 
 
233 aa  345  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  82.98 
 
 
231 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  81.91 
 
 
222 aa  341  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  82.98 
 
 
231 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  82.98 
 
 
231 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  81.38 
 
 
231 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  80.32 
 
 
234 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  71.11 
 
 
184 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  72.83 
 
 
184 aa  295  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  66.29 
 
 
179 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  65.71 
 
 
179 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  65.71 
 
 
179 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  66.67 
 
 
178 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.67 
 
 
178 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.1 
 
 
178 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.54 
 
 
178 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.62 
 
 
177 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.34 
 
 
178 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.05 
 
 
177 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.05 
 
 
177 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.05 
 
 
177 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  62.86 
 
 
178 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.21 
 
 
181 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.68 
 
 
195 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.25 
 
 
173 aa  192  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40 
 
 
172 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.41 
 
 
172 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  36.42 
 
 
226 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  37.95 
 
 
158 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.69 
 
 
215 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.55 
 
 
180 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  37.5 
 
 
155 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2654  4Fe-4S binding domain protein  35.03 
 
 
225 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0493248  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5356  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  31.63 
 
 
211 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  0.130334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.89 
 
 
155 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  39.18 
 
 
163 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0111  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.14 
 
 
214 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.26 
 
 
161 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  37.3 
 
 
176 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.39 
 
 
158 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.57 
 
 
157 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  35.63 
 
 
280 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5461  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.08 
 
 
218 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.04 
 
 
170 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.55 
 
 
173 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1570  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.57 
 
 
157 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0820711  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0223  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.59 
 
 
158 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2205  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase small subunit CoxS/CutS  39.1 
 
 
161 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0357441  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1143  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.65 
 
 
211 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.290254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2225  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.95 
 
 
167 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.755568  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5103  oxidoreductase with iron-sulfur subunit  33.02 
 
 
212 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2166  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.09 
 
 
208 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1675  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.37 
 
 
162 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.416655  normal  0.458733 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2647  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.81 
 
 
162 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.41 
 
 
138 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.94 
 
 
168 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0292  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.62 
 
 
197 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.84 
 
 
219 aa  99.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0170  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.81 
 
 
173 aa  99  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6206  putative xanthine dehydrogenase YagT-like, iron-sulfur binding subunit  34.48 
 
 
169 aa  98.6  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2774  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1257  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.61 
 
 
160 aa  98.6  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3095  (2Fe-2S)-binding protein  36.31 
 
 
164 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5318  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  36.02 
 
 
161 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0965  (2Fe-2S)-binding protein  38.55 
 
 
165 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517192  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.42 
 
 
157 aa  97.8  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3112  (2Fe-2S)-binding protein  39.31 
 
 
162 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153526  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  35.03 
 
 
493 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.59 
 
 
154 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652402  normal  0.0357628 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3029  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.89 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.34 
 
 
405 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4660  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  35.26 
 
 
215 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10379  carbon monoxyde dehydrogenase small subunit  35.98 
 
 
159 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000418965  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.2 
 
 
154 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  35.93 
 
 
164 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1007  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.61 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5490  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.79 
 
 
215 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2931  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.95 
 
 
164 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0748956  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0100  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.55 
 
 
236 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2607  (2Fe-2S)-binding  36.81 
 
 
161 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0075  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.41 
 
 
165 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2040  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.59 
 
 
183 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1024  (2Fe-2S)-binding  34.94 
 
 
165 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89544  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3678  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  37.01 
 
 
165 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1631  (2Fe-2S)-binding  36.02 
 
 
161 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4638  (2Fe-2S)-binding  32.56 
 
 
179 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1993  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  34.59 
 
 
215 aa  96.3  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0972  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.89 
 
 
160 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0216815  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4071  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.98 
 
 
152 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1763  (2Fe-2S)-binding  38.51 
 
 
161 aa  95.9  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.102431  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4202  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.07 
 
 
240 aa  95.9  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3103  (2Fe-2S)-binding protein  35.76 
 
 
156 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101445  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0501  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.15 
 
 
191 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.671579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0479  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.15 
 
 
191 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0490  (2Fe-2S)-binding protein  34.15 
 
 
191 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1513  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.25 
 
 
163 aa  95.5  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0298  glyceraldehyde oxidoreductase small chain  33.13 
 
 
162 aa  95.5  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.68 
 
 
488 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4513  (2Fe-2S)-binding protein  33.72 
 
 
178 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.364072  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1361  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.54 
 
 
174 aa  95.1  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0152772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>