More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3170 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
195 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  63.64 
 
 
233 aa  249  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.64 
 
 
231 aa  246  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.64 
 
 
231 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  63.1 
 
 
231 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.1 
 
 
231 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.1 
 
 
234 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.03 
 
 
222 aa  244  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.73 
 
 
184 aa  232  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.68 
 
 
260 aa  231  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  55.26 
 
 
184 aa  227  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  55.15 
 
 
179 aa  221  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.45 
 
 
178 aa  221  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.99 
 
 
181 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.45 
 
 
177 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  56.32 
 
 
179 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.45 
 
 
177 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.45 
 
 
177 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.45 
 
 
177 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  53.93 
 
 
178 aa  216  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  55.26 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.12 
 
 
178 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.08 
 
 
178 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.08 
 
 
178 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.08 
 
 
178 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.03 
 
 
173 aa  178  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.76 
 
 
172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.36 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  34.04 
 
 
250 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.57 
 
 
241 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.45 
 
 
157 aa  104  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.29 
 
 
158 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  35.59 
 
 
153 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5318  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  37.28 
 
 
161 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0111  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.83 
 
 
214 aa  101  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  35.71 
 
 
155 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  33.71 
 
 
154 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5461  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.22 
 
 
218 aa  101  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0425  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  36.31 
 
 
169 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.56858  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3871  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.77 
 
 
154 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2225  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.43 
 
 
167 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.755568  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  36.14 
 
 
483 aa  99.8  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3931  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.67 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0278463  normal  0.0911563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3678  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  37.43 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1675  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.46 
 
 
162 aa  99.4  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.416655  normal  0.458733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  33.14 
 
 
226 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.59 
 
 
157 aa  99  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1782  (2Fe-2S)-binding  34.86 
 
 
165 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.381616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2205  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase small subunit CoxS/CutS  34.29 
 
 
161 aa  98.6  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0357441  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1143  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.91 
 
 
211 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.290254 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  33.73 
 
 
161 aa  98.2  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5441  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.93 
 
 
166 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.75 
 
 
219 aa  97.8  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.15 
 
 
180 aa  97.8  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  35.63 
 
 
161 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.5 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2654  4Fe-4S binding domain protein  32.57 
 
 
225 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0493248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2775  hypothetical protein  37.28 
 
 
157 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119286  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.08 
 
 
249 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.39 
 
 
154 aa  97.1  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4603  (2Fe-2S)-binding protein  37.5 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.5 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  33.16 
 
 
280 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  36.36 
 
 
151 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  34.86 
 
 
164 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.28 
 
 
259 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4326  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.29 
 
 
161 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.399446  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1007  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  29.41 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1318  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  32.2 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0348872  normal  0.0406737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1039  (2Fe-2S)-binding  34.86 
 
 
168 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0365  (2Fe-2S)-binding  35.8 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1749  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.93 
 
 
166 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877477  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.09 
 
 
170 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3318  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.22 
 
 
229 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  37.5 
 
 
158 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1257  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.4 
 
 
160 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1631  (2Fe-2S)-binding  34.48 
 
 
161 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5103  oxidoreductase with iron-sulfur subunit  30.85 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.52 
 
 
168 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0332  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  31.22 
 
 
229 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4014  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.04 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00245  predicted xanthine dehydrogenase, 2Fe-2S subunit  31.22 
 
 
229 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2813  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.59 
 
 
165 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.884029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  33.14 
 
 
153 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00248  hypothetical protein  31.22 
 
 
229 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1024  (2Fe-2S)-binding  32.2 
 
 
165 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89544  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2607  (2Fe-2S)-binding  37.28 
 
 
161 aa  95.5  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.51 
 
 
164 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3040  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.59 
 
 
165 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22503  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.61 
 
 
215 aa  95.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00927  putative oxidoreductase, iron-sulphur binding subunit  31.69 
 
 
165 aa  95.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3333  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  31.22 
 
 
229 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0574  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  33.15 
 
 
161 aa  95.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.44 
 
 
173 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1133  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  32.62 
 
 
218 aa  94.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.33 
 
 
166 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  33.33 
 
 
166 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.33 
 
 
166 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  34.66 
 
 
163 aa  94.7  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>