More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1416 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  100 
 
 
184 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  74.16 
 
 
184 aa  299  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  74.43 
 
 
233 aa  296  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.71 
 
 
234 aa  295  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.71 
 
 
231 aa  294  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.71 
 
 
222 aa  293  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.71 
 
 
231 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  73.71 
 
 
231 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.71 
 
 
231 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  71.59 
 
 
260 aa  288  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  61.8 
 
 
179 aa  254  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  61.8 
 
 
179 aa  249  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  61.8 
 
 
179 aa  248  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.47 
 
 
177 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.47 
 
 
177 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.47 
 
 
177 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.47 
 
 
177 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.05 
 
 
178 aa  240  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  58.05 
 
 
178 aa  239  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.55 
 
 
178 aa  237  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.55 
 
 
178 aa  237  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.55 
 
 
178 aa  234  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.06 
 
 
181 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.99 
 
 
178 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.26 
 
 
195 aa  227  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.7 
 
 
173 aa  186  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.05 
 
 
172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.24 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5490  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.8 
 
 
215 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.41 
 
 
138 aa  104  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  35.06 
 
 
155 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.74 
 
 
180 aa  101  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1675  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.94 
 
 
162 aa  101  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.416655  normal  0.458733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.15 
 
 
170 aa  99  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1143  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.68 
 
 
211 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.290254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  34.57 
 
 
154 aa  98.2  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  34.48 
 
 
280 aa  97.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  34.16 
 
 
158 aa  97.1  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.15 
 
 
155 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2109  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  33.33 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3029  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.42 
 
 
246 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4660  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  32.96 
 
 
215 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  30.77 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1133  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  35.19 
 
 
218 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1570  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.71 
 
 
157 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0820711  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0058  (2Fe-2S)-binding  37.65 
 
 
161 aa  95.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.325348  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00927  putative oxidoreductase, iron-sulphur binding subunit  34.12 
 
 
165 aa  95.1  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  30.32 
 
 
259 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.14 
 
 
173 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.54 
 
 
154 aa  94.7  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652402  normal  0.0357628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3040  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.27 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22503  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1993  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  30.77 
 
 
215 aa  94  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2813  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.27 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.884029 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  34.13 
 
 
153 aa  94  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  31.28 
 
 
250 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4105  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.17 
 
 
168 aa  93.6  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83677  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2175  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.55 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5103  oxidoreductase with iron-sulfur subunit  31.84 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1024  (2Fe-2S)-binding  31.93 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89544  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.37 
 
 
215 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2647  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.72 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0111  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.2 
 
 
214 aa  92.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241317 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  30.17 
 
 
241 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4261  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.52 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.793616  normal  0.381135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3112  (2Fe-2S)-binding protein  34.76 
 
 
162 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153526  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  31.95 
 
 
163 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8335  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.42 
 
 
211 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.733806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2152  (2Fe-2S)-binding domain protein  30.36 
 
 
164 aa  92  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.09 
 
 
157 aa  92  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0499  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.55 
 
 
155 aa  92  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577821  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3103  (2Fe-2S)-binding protein  34.97 
 
 
156 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101445  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0170  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.58 
 
 
173 aa  92  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1513  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.46 
 
 
163 aa  92  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3376  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.42 
 
 
246 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0913  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  32.53 
 
 
161 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.93 
 
 
161 aa  91.7  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.18 
 
 
154 aa  91.7  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2864  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.75 
 
 
251 aa  91.7  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3557  (2Fe-2S)-binding  36.81 
 
 
152 aa  91.7  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.608806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2532  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  35.8 
 
 
169 aa  91.3  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0552242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  31.1 
 
 
226 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0595  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.57 
 
 
168 aa  91.3  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  30.56 
 
 
219 aa  91.3  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3095  (2Fe-2S)-binding protein  32.57 
 
 
164 aa  90.9  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.33 
 
 
405 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1257  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.55 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5318  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  34.16 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2341  (2Fe-2S)-binding  32.54 
 
 
252 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6668  putative carbon monoxide dehydrogenase, small chain CutC  33.95 
 
 
159 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.241103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3001  ferredoxin  32.37 
 
 
251 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2955  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.54 
 
 
252 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0333193  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1673  selenium-dependent molybdenum hydroxylase 1  31.87 
 
 
858 aa  89.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2076  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.07 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499265  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2883  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.33 
 
 
162 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.36 
 
 
249 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.53 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5356  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  33.12 
 
 
211 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  0.130334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0574  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  34.36 
 
 
161 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0292  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  30.51 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4638  (2Fe-2S)-binding  31.4 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>