More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0967 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
177 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  99.44 
 
 
177 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  99.44 
 
 
177 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  99.44 
 
 
177 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  89.83 
 
 
178 aa  342  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  87.57 
 
 
178 aa  331  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.49 
 
 
184 aa  250  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.27 
 
 
234 aa  246  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.27 
 
 
231 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.12 
 
 
231 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.12 
 
 
222 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  58.62 
 
 
233 aa  244  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  59.54 
 
 
231 aa  243  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.54 
 
 
231 aa  243  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.62 
 
 
260 aa  243  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  57.47 
 
 
184 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  54.02 
 
 
179 aa  224  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  52.87 
 
 
179 aa  222  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  52.35 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.45 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.18 
 
 
181 aa  208  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
178 aa  206  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.72 
 
 
178 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
178 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
178 aa  203  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.12 
 
 
173 aa  191  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.37 
 
 
172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.37 
 
 
172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.37 
 
 
155 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  39.53 
 
 
155 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0298  glyceraldehyde oxidoreductase small chain  37.33 
 
 
162 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  37.35 
 
 
163 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.74 
 
 
168 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  38.89 
 
 
158 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0170  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.28 
 
 
173 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  37.84 
 
 
163 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0499  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.18 
 
 
155 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577821  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  36.31 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3095  (2Fe-2S)-binding protein  37.29 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.65 
 
 
158 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6671  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.67 
 
 
178 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118313  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  34.94 
 
 
163 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3128  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.86 
 
 
158 aa  98.6  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0546642 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1513  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.8 
 
 
163 aa  98.6  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1999  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  40.12 
 
 
853 aa  98.2  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0220  putative dehydrogenase  38.32 
 
 
951 aa  97.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.733217  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.58 
 
 
138 aa  97.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2183  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.05 
 
 
185 aa  97.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  36.36 
 
 
161 aa  97.4  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  35.37 
 
 
226 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  36.69 
 
 
153 aa  97.1  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3112  (2Fe-2S)-binding protein  35.93 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153526  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5888  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  38.62 
 
 
190 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00574873  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2075  oxidoreductase, iron-sulfur subunit  36.05 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8052  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  30 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.71 
 
 
249 aa  95.9  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.25 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.32 
 
 
164 aa  95.9  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  31.03 
 
 
158 aa  95.9  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2054  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.65 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.682344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  35.54 
 
 
163 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2864  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.5 
 
 
251 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0449  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.57 
 
 
163 aa  95.1  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.583963  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1746  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.32 
 
 
191 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1024  (2Fe-2S)-binding  33.13 
 
 
165 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89544  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.03 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.67 
 
 
158 aa  95.5  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000354076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  34.13 
 
 
164 aa  95.1  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0365  (2Fe-2S)-binding  38.55 
 
 
173 aa  95.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2341  (2Fe-2S)-binding  37.72 
 
 
252 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2955  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.72 
 
 
252 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0333193  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  34.57 
 
 
155 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.27 
 
 
157 aa  94  9e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3001  ferredoxin  34.91 
 
 
251 aa  94  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  33.33 
 
 
153 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1891  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  36.02 
 
 
152 aa  93.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2976  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.92 
 
 
252 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1675  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.57 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.416655  normal  0.458733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3557  (2Fe-2S)-binding  33.54 
 
 
152 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.608806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.13 
 
 
157 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1247  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  38.1 
 
 
914 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.265389  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.76 
 
 
155 aa  94  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0582  twin-arginine translocation pathway signal  34.62 
 
 
199 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.52 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4483  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.58 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.14 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  32 
 
 
250 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  35.14 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3029  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.09 
 
 
246 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0223  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.57 
 
 
158 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3871  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.13 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.16 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2654  4Fe-4S binding domain protein  33.95 
 
 
225 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0493248  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6320  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.11 
 
 
157 aa  92.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0574  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  33.33 
 
 
161 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0913  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  32.52 
 
 
161 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0528  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.76 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2229  (2Fe-2S)-binding domain protein  39.16 
 
 
882 aa  92.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0514525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  33.74 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>