More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1275 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
173 aa  357  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.8 
 
 
231 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  57.99 
 
 
231 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.99 
 
 
231 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  56.21 
 
 
233 aa  207  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.21 
 
 
231 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.62 
 
 
234 aa  204  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.25 
 
 
222 aa  201  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.66 
 
 
184 aa  194  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.12 
 
 
177 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.25 
 
 
260 aa  191  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.12 
 
 
177 aa  190  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.12 
 
 
177 aa  190  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.12 
 
 
177 aa  190  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  55.42 
 
 
178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.53 
 
 
178 aa  188  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  52.41 
 
 
179 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  49.7 
 
 
184 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  52.41 
 
 
179 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  52.12 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.03 
 
 
195 aa  178  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.78 
 
 
181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.39 
 
 
178 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.39 
 
 
178 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.39 
 
 
178 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.39 
 
 
178 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.46 
 
 
172 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.07 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4272  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  41.56 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.85 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2836  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.65 
 
 
171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  40.24 
 
 
250 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  41.03 
 
 
176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  39.29 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.67 
 
 
161 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  38.41 
 
 
155 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0737  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  39.22 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.22 
 
 
158 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000354076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.79 
 
 
154 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652402  normal  0.0357628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2135  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  40 
 
 
171 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  38.89 
 
 
153 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0843  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.63 
 
 
160 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.37 
 
 
173 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  40.65 
 
 
161 aa  104  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.41 
 
 
157 aa  104  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2931  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.31 
 
 
164 aa  104  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0748956  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5461  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.15 
 
 
218 aa  103  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4400  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.65 
 
 
198 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943742  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2765  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.46 
 
 
165 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00163035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0340  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.75 
 
 
163 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.54 
 
 
185 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0972  (2Fe-2S)-binding domain protein  41.51 
 
 
160 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0216815  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1763  (2Fe-2S)-binding  36.14 
 
 
161 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.102431  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0058  (2Fe-2S)-binding  38.18 
 
 
161 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.325348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2775  hypothetical protein  39.07 
 
 
157 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119286  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.52 
 
 
168 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  38.04 
 
 
157 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2813  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.87 
 
 
165 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.884029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3040  (2Fe-2S)-binding domain protein  39.87 
 
 
165 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22503  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0100  (2Fe-2S)-binding domain protein  39.18 
 
 
236 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2660  putative carbon monoxide dehydrogenase  36.75 
 
 
162 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175738  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  38.46 
 
 
163 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.99 
 
 
164 aa  101  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1445  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.65 
 
 
158 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.71 
 
 
170 aa  100  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2864  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.24 
 
 
251 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3001  ferredoxin  39.24 
 
 
251 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.85 
 
 
249 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  39.22 
 
 
158 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1818  (2Fe-2S)-binding  39.1 
 
 
156 aa  100  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0449  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.08 
 
 
163 aa  100  9e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.583963  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0511  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40 
 
 
165 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3204  putative oxidoreductase  36.97 
 
 
173 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00927  putative oxidoreductase, iron-sulphur binding subunit  40.85 
 
 
165 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.76 
 
 
158 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4528  (2Fe-2S)-binding  36.97 
 
 
161 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  39.35 
 
 
164 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  39.88 
 
 
157 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1513  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.31 
 
 
163 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2568  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.61 
 
 
160 aa  99.8  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133715  hitchhiker  0.000000432495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  36.31 
 
 
226 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2183  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.77 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2878  putative carbon-monoxide dehydrogenase small chain  36.05 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685063  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.72 
 
 
219 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936329 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4660  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  34.91 
 
 
215 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0527  twin-arginine translocation pathway signal  36.94 
 
 
227 aa  99.4  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000232216  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.9 
 
 
259 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117621 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2976  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.87 
 
 
252 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2654  4Fe-4S binding domain protein  36.31 
 
 
225 aa  99  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0493248  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  36.84 
 
 
280 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1335  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.41 
 
 
160 aa  99  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025313 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5103  oxidoreductase with iron-sulfur subunit  36.09 
 
 
212 aa  99  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1675  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.56 
 
 
162 aa  98.6  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.416655  normal  0.458733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.57 
 
 
405 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3810  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.93 
 
 
257 aa  98.6  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4547  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.97 
 
 
152 aa  98.6  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6206  putative xanthine dehydrogenase YagT-like, iron-sulfur binding subunit  36.88 
 
 
169 aa  98.6  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2774  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.04 
 
 
215 aa  98.6  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2054  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.88 
 
 
191 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.682344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>