More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2135 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2135  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  100 
 
 
171 aa  347  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2836  (2Fe-2S)-binding domain protein  86.55 
 
 
171 aa  307  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.7 
 
 
154 aa  180  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1735  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.61 
 
 
157 aa  177  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.94 
 
 
161 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2660  putative carbon monoxide dehydrogenase  53.9 
 
 
162 aa  173  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175738  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0229  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.55 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903003  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  52.29 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3075  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  55.78 
 
 
160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0490  (2Fe-2S)-binding protein  51.7 
 
 
191 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0479  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.7 
 
 
191 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0501  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.7 
 
 
191 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.671579 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0237  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.88 
 
 
168 aa  168  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2520  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.06 
 
 
228 aa  168  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.746665  normal  0.752418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4272  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.78 
 
 
167 aa  168  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0610  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.88 
 
 
170 aa  167  6e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.579224  normal  0.873609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  52.45 
 
 
155 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2765  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.68 
 
 
165 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00163035  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0449  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.38 
 
 
163 aa  164  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.583963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  50.67 
 
 
176 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
185 aa  164  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1766  (2Fe-2S)-binding  53.38 
 
 
161 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0340  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.29 
 
 
163 aa  163  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.68 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000354076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  52.9 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1142  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.35 
 
 
160 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.442126  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1361  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.01 
 
 
174 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2152  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.32 
 
 
164 aa  162  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3388  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.95 
 
 
156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1469  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  53.47 
 
 
175 aa  160  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0843  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.63 
 
 
160 aa  160  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2001  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.98 
 
 
166 aa  160  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1354  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.35 
 
 
175 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0972  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.32 
 
 
160 aa  159  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0216815  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  54.61 
 
 
161 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.99 
 
 
157 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1418  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.15 
 
 
175 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274063  normal  0.518826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1379  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.97 
 
 
162 aa  159  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.803188  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0737  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  50.67 
 
 
163 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3095  (2Fe-2S)-binding protein  51.02 
 
 
164 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1763  (2Fe-2S)-binding  50 
 
 
161 aa  158  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.102431  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0528  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
171 aa  158  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1524  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.68 
 
 
160 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.152044  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2878  putative carbon-monoxide dehydrogenase small chain  50 
 
 
160 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685063  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10379  carbon monoxyde dehydrogenase small subunit  48.08 
 
 
159 aa  156  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000418965  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.34 
 
 
164 aa  156  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2184  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.97 
 
 
160 aa  155  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.30857  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0810  oxidoreductase, iron-sulfur subunit  50 
 
 
175 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0953  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
175 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.749232  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2696  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.68 
 
 
164 aa  155  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0280354  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0298  glyceraldehyde oxidoreductase small chain  48.68 
 
 
162 aa  155  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0645  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.68 
 
 
158 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1323  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.67 
 
 
151 aa  156  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0095  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.34 
 
 
166 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739421  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2654  4Fe-4S binding domain protein  48.48 
 
 
225 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0493248  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  48.34 
 
 
163 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4105  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.55 
 
 
168 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83677  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1873  (2Fe-2S)-binding protein  48.99 
 
 
191 aa  155  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1563  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  47.71 
 
 
165 aa  155  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  49.37 
 
 
226 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6668  putative carbon monoxide dehydrogenase, small chain CutC  53.69 
 
 
159 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.241103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6206  putative xanthine dehydrogenase YagT-like, iron-sulfur binding subunit  49.66 
 
 
169 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2774  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  50 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1748  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  51.35 
 
 
166 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779963 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1746  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.69 
 
 
191 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  50 
 
 
153 aa  154  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2096  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  47.62 
 
 
164 aa  153  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.483624  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2509  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.3 
 
 
164 aa  153  9e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3871  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.08 
 
 
154 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.85 
 
 
168 aa  153  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.32 
 
 
158 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2837  (2Fe-2S)-binding protein  49.66 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.126759  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2054  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.06 
 
 
191 aa  151  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.682344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2040  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.85 
 
 
183 aa  150  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4925  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.15 
 
 
178 aa  150  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.117712  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5888  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  46.75 
 
 
190 aa  150  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00574873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2568  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.62 
 
 
160 aa  150  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133715  hitchhiker  0.000000432495 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1211  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.71 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.103278  normal  0.545927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2775  hypothetical protein  50.35 
 
 
157 aa  150  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119286  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1527  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  48.34 
 
 
166 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.496565  normal  0.655481 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0416  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.39 
 
 
159 aa  150  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.32 
 
 
164 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  45.09 
 
 
250 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4603  (2Fe-2S)-binding protein  51.32 
 
 
164 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1247  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  50.34 
 
 
914 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.265389  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1637  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.5 
 
 
161 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.32 
 
 
164 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0194  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.65 
 
 
154 aa  149  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4071  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
152 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0111  (2Fe-2S)-binding protein  47.3 
 
 
161 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349058  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0223  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.94 
 
 
158 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.09 
 
 
241 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0075  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.37 
 
 
165 aa  148  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1872  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.67 
 
 
172 aa  148  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4004  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
161 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213376  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3026  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.68 
 
 
165 aa  148  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.513665  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
157 aa  148  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20910  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, small subunit CoxS/CutS-like protein  51.39 
 
 
174 aa  148  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.670207  decreased coverage  0.00505863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1445  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.62 
 
 
158 aa  148  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3970  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.65 
 
 
156 aa  148  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>