More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2509 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2509  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
164 aa  333  7e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2166  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.75 
 
 
208 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2931  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.03 
 
 
164 aa  167  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0748956  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2520  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.34 
 
 
228 aa  166  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.746665  normal  0.752418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.48 
 
 
215 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2813  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.84 
 
 
165 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.884029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3040  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.84 
 
 
165 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22503  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.56 
 
 
164 aa  163  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6206  putative xanthine dehydrogenase YagT-like, iron-sulfur binding subunit  53.25 
 
 
169 aa  161  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2774  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0582  twin-arginine translocation pathway signal  55.56 
 
 
199 aa  160  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0916  twin-arginine translocation pathway signal  52.29 
 
 
233 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  53.59 
 
 
164 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3308  oxidoreductase, small subunit, putative  55.86 
 
 
175 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.0215353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2836  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.35 
 
 
171 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2435  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.86 
 
 
175 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.74315  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.31 
 
 
175 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0972  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.39 
 
 
160 aa  157  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0216815  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.94 
 
 
168 aa  157  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1039  (2Fe-2S)-binding  50.99 
 
 
168 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.41 
 
 
154 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0511  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.43 
 
 
165 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.98 
 
 
158 aa  155  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.79 
 
 
157 aa  154  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0111  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.79 
 
 
214 aa  154  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2135  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  49.3 
 
 
171 aa  153  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  51.48 
 
 
250 aa  153  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0645  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50 
 
 
158 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3001  ferredoxin  54.9 
 
 
251 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2864  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.9 
 
 
251 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.38 
 
 
241 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1168  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.37 
 
 
173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5356  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  49.4 
 
 
211 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  0.130334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1434  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.59 
 
 
208 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.0320908 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0100  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.29 
 
 
236 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0527  twin-arginine translocation pathway signal  46.91 
 
 
227 aa  150  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000232216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  53.38 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4202  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
240 aa  150  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0843  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.94 
 
 
160 aa  149  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152719 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.95 
 
 
259 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.36 
 
 
180 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.68 
 
 
168 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919817  normal  0.26709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.82 
 
 
173 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0237  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.34 
 
 
168 aa  148  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0340  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.16 
 
 
163 aa  148  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  48.05 
 
 
226 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
164 aa  148  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.25 
 
 
249 aa  148  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  45.96 
 
 
280 aa  147  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1537  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.03 
 
 
163 aa  147  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.73336  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2976  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.25 
 
 
252 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  52.03 
 
 
176 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0610  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.34 
 
 
170 aa  147  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.579224  normal  0.873609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0229  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.65 
 
 
181 aa  147  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903003  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1735  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.1 
 
 
157 aa  147  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2341  (2Fe-2S)-binding  52.9 
 
 
252 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2955  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.9 
 
 
252 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0333193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2654  4Fe-4S binding domain protein  49.66 
 
 
225 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0493248  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1527  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.16 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.496565  normal  0.655481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.67 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1220  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain- containing protein  43.95 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3029  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.6 
 
 
246 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4234  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.36 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.62 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2152  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.95 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0416  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.65 
 
 
159 aa  145  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.24 
 
 
138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2561  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.2 
 
 
168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.59 
 
 
219 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1318  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  50 
 
 
181 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0348872  normal  0.0406737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5461  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.03 
 
 
218 aa  144  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1379  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  48 
 
 
162 aa  144  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.803188  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4925  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.22 
 
 
178 aa  144  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.117712  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00245  predicted xanthine dehydrogenase, 2Fe-2S subunit  47.62 
 
 
229 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3318  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.62 
 
 
229 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00248  hypothetical protein  47.62 
 
 
229 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3376  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.33 
 
 
246 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2001  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.05 
 
 
166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0758  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.9 
 
 
174 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368608  normal  0.0841181 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1563  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  44.97 
 
 
165 aa  144  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0297  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  47.62 
 
 
229 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3810  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.25 
 
 
257 aa  143  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1748  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  45.81 
 
 
166 aa  143  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3970  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.5 
 
 
156 aa  143  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0737  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  52.08 
 
 
163 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.79 
 
 
164 aa  143  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0332  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  47.62 
 
 
229 aa  143  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3333  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  47.62 
 
 
229 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2157  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.33 
 
 
166 aa  143  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4735  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.87 
 
 
157 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854984  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0810  oxidoreductase, iron-sulfur subunit  48.59 
 
 
175 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2765  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.98 
 
 
165 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00163035  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  50.35 
 
 
161 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0953  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.59 
 
 
175 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.749232  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0111  (2Fe-2S)-binding protein  45.57 
 
 
161 aa  142  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4335  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.62 
 
 
262 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219943  hitchhiker  0.00586155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4652  iron-sulfur cluster-binding protein  54.36 
 
 
176 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2182  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.26 
 
 
212 aa  141  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.187261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4710  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.92 
 
 
165 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.729129  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1211  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.15 
 
 
163 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.103278  normal  0.545927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1570  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.37 
 
 
157 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0820711  normal  0.486773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>