More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2388 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
226 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2654  4Fe-4S binding domain protein  93.27 
 
 
225 aa  434  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0493248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0527  twin-arginine translocation pathway signal  60.77 
 
 
227 aa  254  6e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000232216  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1223  putative oxidoreductase  57.38 
 
 
183 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5132  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.06 
 
 
183 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4209  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.9 
 
 
182 aa  198  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0582  twin-arginine translocation pathway signal  52.53 
 
 
199 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5461  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.02 
 
 
218 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.26 
 
 
219 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  47.75 
 
 
250 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1993  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  58.75 
 
 
215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3318  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.71 
 
 
229 aa  188  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00245  predicted xanthine dehydrogenase, 2Fe-2S subunit  54.71 
 
 
229 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0297  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  54.71 
 
 
229 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00248  hypothetical protein  54.71 
 
 
229 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0332  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  47.91 
 
 
229 aa  187  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2182  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.44 
 
 
212 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.187261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4202  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.39 
 
 
240 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3810  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.15 
 
 
257 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2166  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.85 
 
 
208 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.69 
 
 
241 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3333  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  46.98 
 
 
229 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.14 
 
 
215 aa  186  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.17 
 
 
259 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117621 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0100  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.83 
 
 
236 aa  184  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4660  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  56.6 
 
 
215 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  59.09 
 
 
164 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2157  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.57 
 
 
166 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1039  (2Fe-2S)-binding  59.6 
 
 
168 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0511  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.89 
 
 
165 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3029  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.85 
 
 
246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6206  putative xanthine dehydrogenase YagT-like, iron-sulfur binding subunit  57.52 
 
 
169 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2774  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5103  oxidoreductase with iron-sulfur subunit  53.89 
 
 
212 aa  181  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5490  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.35 
 
 
215 aa  181  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3958  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.73 
 
 
216 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0786662  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2864  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.08 
 
 
251 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.95 
 
 
164 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  44.34 
 
 
280 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5356  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  52.17 
 
 
211 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  0.130334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0292  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.97 
 
 
197 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2109  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  46.19 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3665  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.27 
 
 
216 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0111  (2Fe-2S)-binding domain protein  44 
 
 
214 aa  178  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3001  ferredoxin  55.06 
 
 
251 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1143  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.98 
 
 
211 aa  178  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.290254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2813  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.48 
 
 
165 aa  178  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.884029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3040  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.48 
 
 
165 aa  178  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22503  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8335  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.55 
 
 
211 aa  177  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.733806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3952  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.94 
 
 
215 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2976  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.98 
 
 
252 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1318  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  54.55 
 
 
181 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0348872  normal  0.0406737 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3376  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.44 
 
 
246 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2341  (2Fe-2S)-binding  50.85 
 
 
252 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2931  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.61 
 
 
164 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0748956  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2955  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.85 
 
 
252 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0333193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.16 
 
 
168 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1434  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.49 
 
 
208 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.0320908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1133  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  45.97 
 
 
218 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2459  oxidoreductase with iron-sulfur subunit  58.5 
 
 
157 aa  175  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4335  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.32 
 
 
262 aa  175  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219943  hitchhiker  0.00586155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0916  twin-arginine translocation pathway signal  51.33 
 
 
233 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.24 
 
 
173 aa  174  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3590  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.85 
 
 
179 aa  174  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3818  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.46 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.156608  normal  0.115442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4261  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.99 
 
 
191 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.793616  normal  0.381135 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.66 
 
 
168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919817  normal  0.26709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3308  oxidoreductase, small subunit, putative  54.49 
 
 
175 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.0215353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.9 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.49 
 
 
180 aa  171  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.55 
 
 
175 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4400  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.7 
 
 
198 aa  170  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943742  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2435  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.55 
 
 
175 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.74315  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1844  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.22 
 
 
167 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00103565  normal  0.0678401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1537  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.03 
 
 
163 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.73336  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4505  twin-arginine translocation pathway signal  50.61 
 
 
224 aa  167  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0758  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.9 
 
 
174 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368608  normal  0.0841181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3356  putative ferredoxin  58.44 
 
 
170 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0795  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.28 
 
 
174 aa  165  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.0664969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0835  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.28 
 
 
174 aa  165  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.153258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39540  putative ferredoxin  58.44 
 
 
170 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.32 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4484  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.94 
 
 
174 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1007  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.09 
 
 
264 aa  162  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3743  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain- containing protein  51.27 
 
 
182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20491  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2561  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.38 
 
 
168 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0633676  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0528  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.32 
 
 
171 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0426  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.67 
 
 
173 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.189891  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0843  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.32 
 
 
160 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0340  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.99 
 
 
163 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4652  iron-sulfur cluster-binding protein  57.42 
 
 
176 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0439  (2Fe-2S)-binding protein  46.67 
 
 
173 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.66 
 
 
161 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0449  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.67 
 
 
173 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0103677 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.68 
 
 
154 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4285  ferredoxin:[2Fe-2S]-binding  56.77 
 
 
176 aa  158  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.678151  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2669  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.38 
 
 
172 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.221156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2836  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.04 
 
 
171 aa  158  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0610  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.98 
 
 
170 aa  158  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.579224  normal  0.873609 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2696  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.98 
 
 
164 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0280354  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  49.35 
 
 
158 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>