More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1906 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  100 
 
 
179 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  84.36 
 
 
179 aa  328  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  83.8 
 
 
179 aa  327  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  83.8 
 
 
178 aa  315  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  83.8 
 
 
178 aa  315  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  83.8 
 
 
178 aa  315  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  83.24 
 
 
178 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  64.04 
 
 
233 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.61 
 
 
231 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.04 
 
 
231 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  66.29 
 
 
260 aa  260  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.36 
 
 
184 aa  260  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.92 
 
 
222 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.48 
 
 
234 aa  258  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  63.48 
 
 
231 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.48 
 
 
231 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  61.8 
 
 
184 aa  254  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.95 
 
 
178 aa  229  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  56.55 
 
 
178 aa  228  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.35 
 
 
177 aa  221  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.35 
 
 
177 aa  221  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.35 
 
 
177 aa  221  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.35 
 
 
177 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.15 
 
 
195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.49 
 
 
181 aa  205  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.12 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.12 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.45 
 
 
172 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1513  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.16 
 
 
163 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0170  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.53 
 
 
173 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  35.9 
 
 
161 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  35.63 
 
 
155 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  38.12 
 
 
154 aa  97.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  32.6 
 
 
250 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  35.5 
 
 
153 aa  95.5  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.54 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.76 
 
 
486 aa  95.1  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2414  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.97 
 
 
160 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  30.91 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.93 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4603  (2Fe-2S)-binding protein  35.93 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.93 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.95 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1361  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.94 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0574  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  34.1 
 
 
161 aa  92  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.33 
 
 
157 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  36.2 
 
 
163 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.55 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2152  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.72 
 
 
164 aa  91.3  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.72 
 
 
155 aa  91.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1570  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.33 
 
 
157 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0820711  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.2 
 
 
158 aa  91.3  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.53 
 
 
249 aa  90.9  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2647  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.92 
 
 
162 aa  90.9  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  30.34 
 
 
259 aa  90.9  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  35.62 
 
 
158 aa  90.9  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3112  (2Fe-2S)-binding protein  36.25 
 
 
162 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153526  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.25 
 
 
241 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  33.96 
 
 
499 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  34.44 
 
 
483 aa  89.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4549  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.93 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730193  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.33 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.11 
 
 
138 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.97 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1818  (2Fe-2S)-binding  33.97 
 
 
156 aa  90.1  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.73 
 
 
173 aa  89  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  34.38 
 
 
161 aa  89  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  35.12 
 
 
163 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.62 
 
 
158 aa  88.6  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000354076  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.52 
 
 
215 aa  88.6  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1999  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  35.19 
 
 
853 aa  88.2  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  35 
 
 
157 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0416  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.54 
 
 
159 aa  88.2  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2540  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  32.53 
 
 
157 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0424992  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0298  glyceraldehyde oxidoreductase small chain  35.46 
 
 
162 aa  88.2  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00927  putative oxidoreductase, iron-sulphur binding subunit  33.14 
 
 
165 aa  88.2  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.19 
 
 
158 aa  87.8  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1024  (2Fe-2S)-binding  31.93 
 
 
165 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89544  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  36.2 
 
 
176 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  35.19 
 
 
163 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0075  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.25 
 
 
165 aa  87.4  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.33 
 
 
157 aa  87.4  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1055  putative iron-sulfur binding protein  37.24 
 
 
173 aa  87.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847853  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2882  putative oxidoreductase  31.55 
 
 
156 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2775  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1922  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.36 
 
 
504 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.501378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4528  (2Fe-2S)-binding  32.35 
 
 
161 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4638  (2Fe-2S)-binding  30.56 
 
 
179 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2246  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.36 
 
 
504 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0100  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.93 
 
 
236 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2341  (2Fe-2S)-binding  31.74 
 
 
252 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2955  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.74 
 
 
252 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0333193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5461  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.07 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1675  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.52 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.416655  normal  0.458733 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.47 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3095  (2Fe-2S)-binding protein  35.48 
 
 
164 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3614  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.89 
 
 
164 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0365  (2Fe-2S)-binding  35.76 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2568  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.53 
 
 
160 aa  86.3  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133715  hitchhiker  0.000000432495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33890  putative oxidoreductase  30.95 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.570354  normal  0.112211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>