More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2246 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0793  xanthine dehydrogenase, small subunit  64.73 
 
 
507 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  64.43 
 
 
523 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  83.93 
 
 
516 aa  863    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  72.03 
 
 
500 aa  733    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  64.52 
 
 
516 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  62.43 
 
 
515 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  62.52 
 
 
527 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  63.29 
 
 
543 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3886  putative xanthine dehydrogenase  65.73 
 
 
507 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2246  xanthine dehydrogenase, small subunit  100 
 
 
504 aa  1037    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  71.69 
 
 
498 aa  724    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  63.8 
 
 
528 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1922  xanthine dehydrogenase, small subunit  96.83 
 
 
504 aa  993    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.501378 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  65.07 
 
 
505 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  63.14 
 
 
520 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  63.8 
 
 
528 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  62.26 
 
 
526 aa  648    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  61.57 
 
 
512 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2042  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  64.87 
 
 
505 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0871  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  64.87 
 
 
505 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3215  xanthine dehydrogenase  64.67 
 
 
505 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2705  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  64.67 
 
 
505 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3160  xanthine dehydrogenase, small subunit  64.87 
 
 
505 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1905  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  64.67 
 
 
505 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3199  xanthine dehydrogenase family protein, iron-sulfur-binding/FAD-binding subunit  64.67 
 
 
505 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188115  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1408  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  65.27 
 
 
592 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  53.31 
 
 
542 aa  551  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5910  xanthine dehydrogenase, small subunit  53.9 
 
 
537 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0799  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  53.76 
 
 
515 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  50.67 
 
 
530 aa  511  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  53.66 
 
 
501 aa  475  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  51.43 
 
 
518 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  46.14 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  47 
 
 
484 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  46.41 
 
 
484 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  49.49 
 
 
507 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  48.76 
 
 
493 aa  435  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  46.78 
 
 
484 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.95 
 
 
507 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  46.36 
 
 
507 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  45.83 
 
 
496 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  46.89 
 
 
492 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0226  xanthine dehydrogenase, small subunit  50.1 
 
 
497 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.89 
 
 
492 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.06 
 
 
512 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1481  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.01 
 
 
571 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0612404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  45.11 
 
 
484 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.74 
 
 
488 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.82 
 
 
479 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.91 
 
 
484 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  46.19 
 
 
490 aa  412  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.91 
 
 
484 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.62 
 
 
492 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.06 
 
 
488 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  47.19 
 
 
493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.48 
 
 
496 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  46.46 
 
 
487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.87 
 
 
484 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  45.93 
 
 
496 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  45.98 
 
 
485 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.51 
 
 
504 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  45.29 
 
 
483 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.57 
 
 
485 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.36 
 
 
485 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.44 
 
 
467 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.01 
 
 
481 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44710  xanthine dehydrogenase  45.77 
 
 
484 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  46.09 
 
 
484 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.31 
 
 
486 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2300  xanthine dehydrogenase small subunit  43.76 
 
 
476 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289203  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.77 
 
 
480 aa  354  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  39.55 
 
 
494 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  38.88 
 
 
480 aa  342  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  37.47 
 
 
499 aa  319  9e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.25 
 
 
468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  38.95 
 
 
461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.11 
 
 
484 aa  300  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1140  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.71 
 
 
552 aa  300  4e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.578898  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  39.83 
 
 
467 aa  293  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.62 
 
 
467 aa  288  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.3 
 
 
514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  31.72 
 
 
1363 aa  233  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.06 
 
 
490 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.22 
 
 
450 aa  205  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  30.48 
 
 
470 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  48.28 
 
 
1387 aa  133  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1570  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.61 
 
 
157 aa  127  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0820711  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
164 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
164 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4603  (2Fe-2S)-binding protein  50 
 
 
164 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.18 
 
 
157 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  46.15 
 
 
161 aa  121  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.71 
 
 
170 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3075  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  42.5 
 
 
160 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.43 
 
 
164 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1872  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.12 
 
 
172 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6668  putative carbon monoxide dehydrogenase, small chain CutC  41.61 
 
 
159 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.241103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.12 
 
 
155 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1354  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.79 
 
 
175 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.0619689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>