More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3799 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
178 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  98.31 
 
 
178 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  98.31 
 
 
178 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  93.26 
 
 
178 aa  348  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  84.36 
 
 
179 aa  315  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  83.8 
 
 
179 aa  314  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  83.24 
 
 
179 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.13 
 
 
184 aa  244  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  65.17 
 
 
260 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  62.36 
 
 
233 aa  241  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.36 
 
 
231 aa  240  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.24 
 
 
222 aa  239  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.8 
 
 
231 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  61.8 
 
 
231 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.8 
 
 
231 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.24 
 
 
234 aa  236  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  59.55 
 
 
184 aa  234  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  54.76 
 
 
178 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.12 
 
 
195 aa  208  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.98 
 
 
178 aa  204  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.8 
 
 
181 aa  204  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
177 aa  204  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
177 aa  204  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.72 
 
 
177 aa  204  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
177 aa  203  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.39 
 
 
173 aa  168  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.97 
 
 
172 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.31 
 
 
172 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  37.5 
 
 
153 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.79 
 
 
486 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0170  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.35 
 
 
173 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  36.13 
 
 
161 aa  104  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1513  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.8 
 
 
163 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2414  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.76 
 
 
160 aa  101  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1361  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.5 
 
 
174 aa  97.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.34 
 
 
161 aa  98.2  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.94 
 
 
157 aa  97.8  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  33.33 
 
 
250 aa  97.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.15 
 
 
173 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.15 
 
 
512 aa  97.1  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.76 
 
 
138 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.48 
 
 
158 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000354076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.55 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  34.76 
 
 
158 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2152  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.95 
 
 
164 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  36.69 
 
 
155 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.04 
 
 
158 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.34 
 
 
164 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.95 
 
 
164 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.91 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.34 
 
 
164 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4603  (2Fe-2S)-binding protein  34.34 
 
 
164 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3103  (2Fe-2S)-binding protein  35.85 
 
 
156 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101445  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4549  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.12 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730193  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.55 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  31.48 
 
 
164 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  34.57 
 
 
158 aa  92.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.33 
 
 
157 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.74 
 
 
259 aa  92  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  34.76 
 
 
499 aa  92  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3112  (2Fe-2S)-binding protein  35.85 
 
 
162 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153526  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2647  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.08 
 
 
162 aa  92  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  35.19 
 
 
154 aa  92  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1766  (2Fe-2S)-binding  38.56 
 
 
161 aa  92  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0075  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.25 
 
 
165 aa  92  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0574  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  35.47 
 
 
161 aa  92  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  34.39 
 
 
543 aa  91.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00927  putative oxidoreductase, iron-sulphur binding subunit  34.52 
 
 
165 aa  91.7  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4335  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.98 
 
 
262 aa  91.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219943  hitchhiker  0.00586155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1143  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.91 
 
 
211 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.290254 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.93 
 
 
180 aa  91.3  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.37 
 
 
164 aa  90.9  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0111  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.76 
 
 
214 aa  90.9  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.97 
 
 
155 aa  90.9  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  32 
 
 
241 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.77 
 
 
485 aa  90.9  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.71 
 
 
168 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0499  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.94 
 
 
155 aa  90.9  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577821  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.77 
 
 
485 aa  90.9  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.93 
 
 
215 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0298  glyceraldehyde oxidoreductase small chain  34.42 
 
 
162 aa  90.9  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.33 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919817  normal  0.26709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1570  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.79 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0820711  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.53 
 
 
249 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3075  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  34.76 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  35.26 
 
 
280 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2540  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  33.95 
 
 
157 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0424992  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6668  putative carbon monoxide dehydrogenase, small chain CutC  33.33 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.241103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0340  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.22 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  36.59 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.94 
 
 
484 aa  89.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1872  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.95 
 
 
172 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.15 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0220  putative dehydrogenase  39.29 
 
 
951 aa  89  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.733217  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5461  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.57 
 
 
218 aa  89  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0365  (2Fe-2S)-binding  36.36 
 
 
173 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6206  putative xanthine dehydrogenase YagT-like, iron-sulfur binding subunit  32.93 
 
 
169 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2774  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2109  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  34.09 
 
 
213 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1763  (2Fe-2S)-binding  38.56 
 
 
161 aa  88.6  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.102431  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  34.59 
 
 
161 aa  88.6  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>