More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1789 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  100 
 
 
484 aa  968    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  48.01 
 
 
484 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  48.01 
 
 
484 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.17 
 
 
488 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.8 
 
 
484 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.8 
 
 
484 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  43.65 
 
 
494 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  49.07 
 
 
496 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.85 
 
 
484 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.45 
 
 
488 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  49.79 
 
 
467 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  45.34 
 
 
484 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  45.77 
 
 
484 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.01 
 
 
515 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.31 
 
 
512 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  45.6 
 
 
543 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  45.53 
 
 
490 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2300  xanthine dehydrogenase small subunit  49.37 
 
 
476 aa  378  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289203  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  47.93 
 
 
484 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44710  xanthine dehydrogenase  47.93 
 
 
484 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  46.06 
 
 
479 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.42 
 
 
516 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  46.63 
 
 
496 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.46 
 
 
493 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.98 
 
 
528 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.68 
 
 
480 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.25 
 
 
520 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.03 
 
 
523 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  44.78 
 
 
528 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  43.88 
 
 
496 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.48 
 
 
526 aa  362  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.4 
 
 
527 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.33 
 
 
492 aa  360  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  44.47 
 
 
492 aa  359  8e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.47 
 
 
492 aa  358  9e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  43.4 
 
 
499 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.83 
 
 
501 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.15 
 
 
505 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.42 
 
 
487 aa  349  5e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  43.13 
 
 
500 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.94 
 
 
542 aa  348  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  44.23 
 
 
493 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.23 
 
 
481 aa  345  7e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0793  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.12 
 
 
507 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.13 
 
 
530 aa  343  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  42.07 
 
 
498 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0226  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.7 
 
 
497 aa  340  5e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  43.56 
 
 
516 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  40.47 
 
 
480 aa  338  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3886  putative xanthine dehydrogenase  41.86 
 
 
507 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.44 
 
 
467 aa  335  7.999999999999999e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.92 
 
 
518 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.26 
 
 
506 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3199  xanthine dehydrogenase family protein, iron-sulfur-binding/FAD-binding subunit  44.97 
 
 
505 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.2 
 
 
507 aa  332  9e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5910  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.72 
 
 
537 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3215  xanthine dehydrogenase  44.76 
 
 
505 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413066  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1922  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.84 
 
 
504 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.501378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  44.1 
 
 
483 aa  331  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3160  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.97 
 
 
505 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2042  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  44.76 
 
 
505 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0871  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  44.76 
 
 
505 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  44.97 
 
 
485 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.79 
 
 
507 aa  329  7e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2246  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.51 
 
 
504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.24 
 
 
507 aa  326  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1905  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  44.56 
 
 
505 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2705  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  44.56 
 
 
505 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.32 
 
 
504 aa  322  9.000000000000001e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.89 
 
 
485 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1408  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  45.61 
 
 
592 aa  316  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.44 
 
 
467 aa  316  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.99 
 
 
485 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1140  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.97 
 
 
552 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.578898  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.95 
 
 
512 aa  313  5.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  43.07 
 
 
461 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1481  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.18 
 
 
571 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0612404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.7 
 
 
486 aa  303  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0799  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  43.49 
 
 
515 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.43 
 
 
468 aa  272  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  38.29 
 
 
514 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.72 
 
 
490 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  31.95 
 
 
1363 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.64 
 
 
470 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.12 
 
 
450 aa  204  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0552  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  40.61 
 
 
288 aa  154  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  50.68 
 
 
1387 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.66 
 
 
276 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.69 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.82 
 
 
287 aa  130  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.67 
 
 
305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2232  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  34.34 
 
 
288 aa  127  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.894157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  34.78 
 
 
287 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  31.2 
 
 
280 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.44 
 
 
292 aa  123  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4200  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  34.88 
 
 
277 aa  121  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.690695 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.62 
 
 
292 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.34 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  31.97 
 
 
1350 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2144  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  34.19 
 
 
288 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>