More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_61140 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  373  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  98.32 
 
 
179 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  84.36 
 
 
179 aa  328  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  84.36 
 
 
178 aa  316  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  84.36 
 
 
178 aa  316  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  84.36 
 
 
178 aa  315  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  84.36 
 
 
178 aa  314  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.17 
 
 
231 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.41 
 
 
234 aa  258  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.56 
 
 
184 aa  258  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.61 
 
 
231 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  64.61 
 
 
231 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.84 
 
 
222 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  63.48 
 
 
233 aa  257  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.84 
 
 
231 aa  257  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  65.71 
 
 
260 aa  251  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  61.8 
 
 
184 aa  249  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  55.95 
 
 
178 aa  228  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.98 
 
 
178 aa  223  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.87 
 
 
177 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.87 
 
 
177 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.87 
 
 
177 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.87 
 
 
177 aa  222  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.26 
 
 
195 aa  215  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.87 
 
 
181 aa  206  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.41 
 
 
173 aa  186  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.53 
 
 
172 aa  141  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.64 
 
 
172 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  37.36 
 
 
155 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.41 
 
 
486 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2414  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.2 
 
 
160 aa  99.8  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  30.54 
 
 
180 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  36.11 
 
 
161 aa  97.8  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.94 
 
 
173 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2152  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.97 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  36.63 
 
 
153 aa  97.1  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0170  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.73 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  32.18 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  32.79 
 
 
250 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0574  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  36 
 
 
161 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.52 
 
 
161 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.9 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000354076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.73 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0913  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  34.09 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.5 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1361  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.57 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1513  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.77 
 
 
163 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1763  (2Fe-2S)-binding  41.03 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.102431  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0499  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.94 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577821  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.11 
 
 
138 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  33.96 
 
 
499 aa  92.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1024  (2Fe-2S)-binding  32.57 
 
 
165 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89544  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  34.38 
 
 
154 aa  92.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2076  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.42 
 
 
188 aa  92  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499265  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.72 
 
 
155 aa  92  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.97 
 
 
158 aa  92  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.52 
 
 
241 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  33.9 
 
 
280 aa  90.9  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  32.74 
 
 
170 aa  90.9  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.61 
 
 
259 aa  90.9  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6206  putative xanthine dehydrogenase YagT-like, iron-sulfur binding subunit  33.33 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2774  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0298  glyceraldehyde oxidoreductase small chain  33.57 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0595  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.16 
 
 
168 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3095  (2Fe-2S)-binding protein  33.95 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3112  (2Fe-2S)-binding protein  34.15 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153526  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  34.55 
 
 
163 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  35.76 
 
 
483 aa  90.1  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  35 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.57 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  35.5 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  33.93 
 
 
163 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.53 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1570  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.76 
 
 
157 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0820711  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1422  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.53 
 
 
206 aa  89  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.36 
 
 
171 aa  89.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.54 
 
 
157 aa  89.4  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4603  (2Fe-2S)-binding protein  33.53 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.53 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4549  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.99 
 
 
172 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730193  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0340  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.96 
 
 
163 aa  88.6  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.9 
 
 
164 aa  89  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
163 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1039  (2Fe-2S)-binding  31.14 
 
 
168 aa  88.2  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3308  oxidoreductase, small subunit, putative  33.74 
 
 
175 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.0215353 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00927  putative oxidoreductase, iron-sulphur binding subunit  33.33 
 
 
165 aa  88.2  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.74 
 
 
168 aa  88.2  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919817  normal  0.26709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  32.1 
 
 
164 aa  88.2  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1675  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.13 
 
 
162 aa  87.8  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.416655  normal  0.458733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.98 
 
 
158 aa  87.8  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2647  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.47 
 
 
162 aa  87.8  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1818  (2Fe-2S)-binding  35 
 
 
156 aa  87.8  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.68 
 
 
492 aa  87.4  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4528  (2Fe-2S)-binding  32.22 
 
 
161 aa  87.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.261283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0449  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.21 
 
 
163 aa  87  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.583963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1872  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.69 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  34.68 
 
 
492 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  33.73 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2775  hypothetical protein  34.19 
 
 
157 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119286  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3941  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.73 
 
 
181 aa  87  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0075  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.13 
 
 
165 aa  87  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>