More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6203 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.94 
 
 
231 aa  247  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  63.28 
 
 
233 aa  246  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  64.37 
 
 
231 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.37 
 
 
231 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.94 
 
 
222 aa  244  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.64 
 
 
234 aa  241  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.64 
 
 
231 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.99 
 
 
184 aa  237  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.21 
 
 
260 aa  234  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  57.06 
 
 
184 aa  234  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.99 
 
 
195 aa  220  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.18 
 
 
177 aa  208  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  53.45 
 
 
179 aa  207  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.18 
 
 
177 aa  207  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.18 
 
 
177 aa  207  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.18 
 
 
177 aa  207  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  52.87 
 
 
179 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  53.49 
 
 
179 aa  205  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.6 
 
 
178 aa  204  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.8 
 
 
178 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.8 
 
 
178 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.8 
 
 
178 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  52.6 
 
 
178 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.63 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.78 
 
 
173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.98 
 
 
172 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.98 
 
 
172 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  41.57 
 
 
153 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.83 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  40.91 
 
 
161 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0170  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.59 
 
 
173 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.14 
 
 
171 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.04 
 
 
161 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.84 
 
 
157 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.2 
 
 
241 aa  104  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  39.33 
 
 
250 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.74 
 
 
485 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.59 
 
 
138 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.18 
 
 
249 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2864  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.64 
 
 
251 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.74 
 
 
485 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2775  hypothetical protein  44.16 
 
 
157 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119286  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  39.39 
 
 
485 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.63 
 
 
467 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2931  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.14 
 
 
164 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0748956  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3001  ferredoxin  39.05 
 
 
251 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1675  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.59 
 
 
162 aa  100  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.416655  normal  0.458733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  36.21 
 
 
155 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0499  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.25 
 
 
155 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577821  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  41.77 
 
 
155 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  42.54 
 
 
483 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.79 
 
 
168 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  38.51 
 
 
154 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3029  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.17 
 
 
246 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1361  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.57 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.23 
 
 
259 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2540  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.38 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0424992  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1335  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.51 
 
 
160 aa  99.8  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00927  putative oxidoreductase, iron-sulphur binding subunit  37.5 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4735  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.24 
 
 
157 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854984  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0582  twin-arginine translocation pathway signal  40.72 
 
 
199 aa  99  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0449  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.43 
 
 
163 aa  98.6  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.583963  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  37.04 
 
 
280 aa  99  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2225  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.62 
 
 
167 aa  98.6  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.755568  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1039  (2Fe-2S)-binding  41.25 
 
 
168 aa  98.2  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  38.75 
 
 
226 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.03 
 
 
486 aa  97.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2813  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.99 
 
 
165 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.884029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3040  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.99 
 
 
165 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22503  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  39.88 
 
 
173 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.39 
 
 
164 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  35 
 
 
154 aa  97.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4603  (2Fe-2S)-binding protein  45.39 
 
 
164 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1257  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.81 
 
 
160 aa  97.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.39 
 
 
164 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0111  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.43 
 
 
214 aa  97.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1637  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.04 
 
 
161 aa  97.4  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3376  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.07 
 
 
246 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  41.38 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.02 
 
 
158 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000354076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2654  4Fe-4S binding domain protein  38.12 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0493248  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.38 
 
 
164 aa  96.7  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4105  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.12 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83677  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6668  putative carbon monoxide dehydrogenase, small chain CutC  40.62 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.241103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.43 
 
 
215 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2976  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.69 
 
 
252 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0194  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.85 
 
 
154 aa  95.9  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0298  glyceraldehyde oxidoreductase small chain  36.17 
 
 
162 aa  95.9  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2837  (2Fe-2S)-binding protein  43.12 
 
 
153 aa  95.9  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.126759  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1422  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.58 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.68 
 
 
157 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1490  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.63 
 
 
173 aa  95.5  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2836  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.51 
 
 
171 aa  95.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3103  (2Fe-2S)-binding protein  37.89 
 
 
156 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101445  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1872  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.76 
 
 
172 aa  95.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2166  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.12 
 
 
208 aa  94.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4638  (2Fe-2S)-binding  44 
 
 
179 aa  94.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.67 
 
 
168 aa  94.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919817  normal  0.26709 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2647  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.96 
 
 
162 aa  94.7  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>