More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3375 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
177 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
177 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
177 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  99.44 
 
 
177 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  89.83 
 
 
178 aa  342  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  87.57 
 
 
178 aa  331  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.49 
 
 
184 aa  249  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.12 
 
 
231 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.69 
 
 
234 aa  244  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.69 
 
 
231 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  58.62 
 
 
233 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  59.54 
 
 
231 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.54 
 
 
231 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.54 
 
 
222 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.05 
 
 
260 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  57.47 
 
 
184 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  54.02 
 
 
179 aa  225  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  52.87 
 
 
179 aa  222  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  52.35 
 
 
179 aa  221  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.45 
 
 
195 aa  218  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.18 
 
 
181 aa  207  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
178 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.72 
 
 
178 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
178 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
178 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.12 
 
 
173 aa  190  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.37 
 
 
172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.37 
 
 
172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.37 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  39.53 
 
 
155 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0298  glyceraldehyde oxidoreductase small chain  37.33 
 
 
162 aa  102  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  38.51 
 
 
163 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.61 
 
 
168 aa  101  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3095  (2Fe-2S)-binding protein  37.85 
 
 
164 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  36.94 
 
 
161 aa  100  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  37.35 
 
 
163 aa  100  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0499  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.79 
 
 
155 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577821  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0170  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.28 
 
 
173 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1513  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.41 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  34.94 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6671  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.26 
 
 
178 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118313  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.28 
 
 
138 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.65 
 
 
158 aa  99  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2183  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.63 
 
 
185 aa  99  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  38.27 
 
 
158 aa  98.6  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  36.36 
 
 
161 aa  98.6  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  35.98 
 
 
226 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0220  putative dehydrogenase  38.32 
 
 
951 aa  97.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.733217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  37.35 
 
 
153 aa  97.8  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1999  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  40.12 
 
 
853 aa  98.2  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3112  (2Fe-2S)-binding protein  36.53 
 
 
162 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153526  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3128  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.86 
 
 
158 aa  97.8  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0546642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  30.59 
 
 
180 aa  97.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.03 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5888  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  39.31 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00574873  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.31 
 
 
249 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2075  oxidoreductase, iron-sulfur subunit  36.63 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8052  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2054  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.24 
 
 
191 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.682344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  35.54 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2864  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.09 
 
 
251 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.25 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  34.73 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1746  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.92 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.03 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.67 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000354076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.73 
 
 
157 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  31.03 
 
 
158 aa  95.9  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2341  (2Fe-2S)-binding  37.13 
 
 
252 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2955  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.13 
 
 
252 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0333193  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1024  (2Fe-2S)-binding  33.13 
 
 
165 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89544  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3001  ferredoxin  35.5 
 
 
251 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3557  (2Fe-2S)-binding  33.54 
 
 
152 aa  95.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.608806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0365  (2Fe-2S)-binding  38.55 
 
 
173 aa  95.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0449  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.57 
 
 
163 aa  94.7  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.583963  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  33.33 
 
 
153 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1891  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  36.65 
 
 
152 aa  94.7  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  35.81 
 
 
176 aa  94.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0582  twin-arginine translocation pathway signal  35.26 
 
 
199 aa  94.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2976  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.32 
 
 
252 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0223  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.19 
 
 
158 aa  94.4  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.09 
 
 
164 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.78 
 
 
188 aa  94.4  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.76 
 
 
155 aa  94  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.27 
 
 
157 aa  94.4  9e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4483  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.2 
 
 
152 aa  94  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2654  4Fe-4S binding domain protein  34.57 
 
 
225 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0493248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1247  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  38.1 
 
 
914 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.265389  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
170 aa  94  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2229  (2Fe-2S)-binding domain protein  39.16 
 
 
882 aa  93.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0514525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.67 
 
 
157 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6320  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.11 
 
 
157 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5461  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.02 
 
 
218 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.14 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.42 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.12 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.42 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2813  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.8 
 
 
165 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.884029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.53 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4710  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.85 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.729129  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1675  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.57 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.416655  normal  0.458733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>