More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0859 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
178 aa  370  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  89.83 
 
 
177 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  89.83 
 
 
177 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  89.83 
 
 
177 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  89.83 
 
 
177 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  88.76 
 
 
178 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.49 
 
 
184 aa  249  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.43 
 
 
231 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.01 
 
 
234 aa  245  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.01 
 
 
231 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  60.92 
 
 
233 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.85 
 
 
222 aa  243  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.34 
 
 
260 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.27 
 
 
231 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  61.27 
 
 
231 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  58.05 
 
 
184 aa  240  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  55.95 
 
 
179 aa  229  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  54.17 
 
 
179 aa  226  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  52.98 
 
 
179 aa  223  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.45 
 
 
195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.98 
 
 
178 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.98 
 
 
178 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.98 
 
 
178 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.6 
 
 
181 aa  204  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.98 
 
 
178 aa  204  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.53 
 
 
173 aa  188  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.62 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.62 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  39.13 
 
 
155 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  39.53 
 
 
155 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0170  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.12 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  36.75 
 
 
163 aa  98.6  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0298  glyceraldehyde oxidoreductase small chain  36.81 
 
 
162 aa  98.2  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  37.43 
 
 
158 aa  97.8  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1999  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  40.12 
 
 
853 aa  97.1  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  39.87 
 
 
153 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  35.85 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  37.16 
 
 
163 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.85 
 
 
168 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.81 
 
 
158 aa  95.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  34.34 
 
 
163 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0365  (2Fe-2S)-binding  39.38 
 
 
173 aa  94  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.18 
 
 
170 aa  94.4  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.69 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.33 
 
 
158 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000354076  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  35.62 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1513  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.37 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  30.46 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  40.14 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.36 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.97 
 
 
485 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0223  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.8 
 
 
158 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  34.34 
 
 
163 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3164  ferredoxin like protein  34.12 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.758839  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.97 
 
 
485 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  30.54 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.77 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.75 
 
 
138 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0499  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.36 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577821  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.02 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3902  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.12 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  34.57 
 
 
153 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3095  (2Fe-2S)-binding protein  36.65 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3557  (2Fe-2S)-binding  33.54 
 
 
152 aa  92.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.608806 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.01 
 
 
157 aa  92.4  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6671  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.11 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118313  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.57 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2183  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.16 
 
 
185 aa  92  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3128  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.38 
 
 
158 aa  92  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0546642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.75 
 
 
493 aa  92  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  34.66 
 
 
164 aa  92  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2864  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.32 
 
 
251 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2647  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.77 
 
 
162 aa  91.3  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0075  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.31 
 
 
165 aa  91.3  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  33.14 
 
 
226 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.93 
 
 
249 aa  90.9  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2955  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.93 
 
 
252 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0333193  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  34.57 
 
 
155 aa  90.9  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6320  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.11 
 
 
157 aa  90.9  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2341  (2Fe-2S)-binding  35.93 
 
 
252 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1891  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  35.58 
 
 
152 aa  90.9  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.79 
 
 
467 aa  90.9  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3001  ferredoxin  34.91 
 
 
251 aa  90.9  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3112  (2Fe-2S)-binding protein  34.13 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153526  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2775  hypothetical protein  36.54 
 
 
157 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119286  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1024  (2Fe-2S)-binding  31.9 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89544  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1039  (2Fe-2S)-binding  33.33 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2229  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.06 
 
 
882 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0514525 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  35.8 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3049  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  32.95 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2976  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.13 
 
 
252 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2205  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase small subunit CoxS/CutS  34.78 
 
 
161 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0357441  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5318  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  33.14 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00927  putative oxidoreductase, iron-sulphur binding subunit  35.1 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10379  carbon monoxyde dehydrogenase small subunit  34.57 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000418965  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0220  putative dehydrogenase  36.53 
 
 
951 aa  89.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.733217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.92 
 
 
161 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2075  oxidoreductase, iron-sulfur subunit  35.81 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8052  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  34.15 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3029  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.87 
 
 
246 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>