More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4017 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
184 aa  380  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  74.16 
 
 
184 aa  299  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  72.13 
 
 
233 aa  297  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  72.68 
 
 
231 aa  295  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  71.58 
 
 
231 aa  294  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  71.58 
 
 
234 aa  293  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  71.58 
 
 
222 aa  293  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  71.58 
 
 
231 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  71.58 
 
 
231 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  71.11 
 
 
260 aa  289  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  65.36 
 
 
179 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  65.56 
 
 
179 aa  258  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  65.56 
 
 
179 aa  256  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  63.22 
 
 
178 aa  254  7e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.49 
 
 
177 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.49 
 
 
177 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.49 
 
 
177 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.49 
 
 
177 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.49 
 
 
178 aa  249  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.13 
 
 
178 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.13 
 
 
178 aa  244  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.13 
 
 
178 aa  244  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.13 
 
 
178 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.99 
 
 
181 aa  237  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.73 
 
 
195 aa  232  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.66 
 
 
173 aa  194  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.11 
 
 
172 aa  141  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.11 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.06 
 
 
138 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.12 
 
 
180 aa  107  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  37.06 
 
 
158 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1570  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.65 
 
 
157 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0820711  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.8 
 
 
155 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.79 
 
 
170 aa  104  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4603  (2Fe-2S)-binding protein  37.87 
 
 
164 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.87 
 
 
164 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.87 
 
 
164 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.27 
 
 
158 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  40.36 
 
 
153 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.53 
 
 
405 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.42 
 
 
157 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  35.06 
 
 
161 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.33 
 
 
241 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0170  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.98 
 
 
173 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.86 
 
 
185 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3029  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.24 
 
 
246 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3952  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.78 
 
 
215 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  36.78 
 
 
155 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  32.78 
 
 
250 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5103  oxidoreductase with iron-sulfur subunit  33.52 
 
 
212 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5461  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.15 
 
 
218 aa  101  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3376  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.78 
 
 
246 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.15 
 
 
173 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0574  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  36.2 
 
 
161 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2166  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.88 
 
 
208 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1024  (2Fe-2S)-binding  34.15 
 
 
165 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89544  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1675  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.75 
 
 
162 aa  99.8  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.416655  normal  0.458733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2175  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.7 
 
 
161 aa  99.4  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.04 
 
 
157 aa  99  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0058  (2Fe-2S)-binding  38.89 
 
 
161 aa  99  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.325348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4105  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.97 
 
 
168 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83677  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3112  (2Fe-2S)-binding protein  38 
 
 
162 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153526  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.88 
 
 
157 aa  99  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.35 
 
 
219 aa  98.2  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0965  (2Fe-2S)-binding protein  36.81 
 
 
165 aa  98.2  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517192  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0972  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.65 
 
 
160 aa  97.8  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0216815  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1873  (2Fe-2S)-binding protein  36.09 
 
 
191 aa  97.8  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.71 
 
 
215 aa  97.8  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2532  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  37.58 
 
 
169 aa  97.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0552242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6206  putative xanthine dehydrogenase YagT-like, iron-sulfur binding subunit  31.76 
 
 
169 aa  97.8  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2774  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  34.76 
 
 
280 aa  97.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5356  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.76 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3095  (2Fe-2S)-binding protein  33.7 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.19 
 
 
168 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4484  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.67 
 
 
174 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0340  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.93 
 
 
163 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2076  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.26 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499265  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.16 
 
 
154 aa  96.3  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652402  normal  0.0357628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.33 
 
 
390 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  36.65 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
164 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1143  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.14 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.290254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1361  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.15 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00927  putative oxidoreductase, iron-sulphur binding subunit  35.29 
 
 
165 aa  96.7  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2883  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.9 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  34.3 
 
 
226 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1872  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.88 
 
 
172 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.71 
 
 
175 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  36.77 
 
 
163 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.14 
 
 
164 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2341  (2Fe-2S)-binding  32.18 
 
 
252 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2955  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.18 
 
 
252 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0333193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2864  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.33 
 
 
251 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3308  oxidoreductase, small subunit, putative  34.94 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.0215353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.33 
 
 
249 aa  95.5  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3958  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.44 
 
 
216 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0786662  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.55 
 
 
168 aa  95.5  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919817  normal  0.26709 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4549  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.37 
 
 
172 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730193  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2813  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.3 
 
 
165 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.884029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1993  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  31.87 
 
 
215 aa  95.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>