More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3852 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
231 aa  473  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  98.94 
 
 
234 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  96.28 
 
 
231 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  93.62 
 
 
222 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  94.68 
 
 
233 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  95.21 
 
 
231 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  95.21 
 
 
231 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  80.95 
 
 
260 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  74.57 
 
 
184 aa  301  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.6 
 
 
184 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  64.41 
 
 
179 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  63.84 
 
 
179 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  63.84 
 
 
179 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.64 
 
 
195 aa  251  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.27 
 
 
177 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.01 
 
 
178 aa  250  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.69 
 
 
177 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.69 
 
 
177 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.69 
 
 
177 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.36 
 
 
178 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.36 
 
 
178 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  63.79 
 
 
178 aa  248  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.67 
 
 
178 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.58 
 
 
181 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.8 
 
 
178 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.21 
 
 
173 aa  208  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.83 
 
 
172 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.07 
 
 
172 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  37.87 
 
 
155 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  33.85 
 
 
250 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.16 
 
 
241 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2864  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.41 
 
 
251 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  36.11 
 
 
176 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  36.26 
 
 
163 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1570  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.99 
 
 
157 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0820711  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.73 
 
 
249 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2341  (2Fe-2S)-binding  35.33 
 
 
252 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1675  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.37 
 
 
162 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.416655  normal  0.458733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3001  ferredoxin  34.55 
 
 
251 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2955  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.33 
 
 
252 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0333193  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2976  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.33 
 
 
252 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.83 
 
 
215 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.12 
 
 
180 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  38.32 
 
 
153 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0111  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.85 
 
 
214 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3029  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.56 
 
 
246 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.17 
 
 
219 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.73 
 
 
405 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.42 
 
 
157 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.2 
 
 
170 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.59 
 
 
164 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.95 
 
 
259 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  35.54 
 
 
158 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3112  (2Fe-2S)-binding protein  38.04 
 
 
162 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153526  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.93 
 
 
161 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.94 
 
 
173 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0365  (2Fe-2S)-binding  38.65 
 
 
173 aa  98.6  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00927  putative oxidoreductase, iron-sulphur binding subunit  35.29 
 
 
165 aa  98.6  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0737  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  36.75 
 
 
163 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0582  twin-arginine translocation pathway signal  32.84 
 
 
199 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.19 
 
 
154 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652402  normal  0.0357628 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5888  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  35 
 
 
190 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00574873  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3376  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.44 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0058  (2Fe-2S)-binding  37.27 
 
 
161 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.325348  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0100  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.29 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.97 
 
 
154 aa  96.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2931  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.89 
 
 
164 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0748956  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2540  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.8 
 
 
157 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0424992  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.13 
 
 
467 aa  96.3  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0170  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.67 
 
 
173 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2775  hypothetical protein  37.11 
 
 
157 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119286  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1361  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.94 
 
 
174 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4071  (2Fe-2S)-binding domain protein  39.51 
 
 
152 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2166  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.98 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.45 
 
 
168 aa  95.9  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919817  normal  0.26709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0499  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.76 
 
 
155 aa  95.9  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577821  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  33.96 
 
 
161 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2695  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  37.04 
 
 
903 aa  95.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.980449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3040  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.2 
 
 
165 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22503  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5461  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.02 
 
 
218 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2813  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.2 
 
 
165 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.884029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.75 
 
 
138 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  36.42 
 
 
161 aa  95.1  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2568  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.27 
 
 
160 aa  95.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133715  hitchhiker  0.000000432495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.38 
 
 
168 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2184  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.75 
 
 
160 aa  94.7  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.30857  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1631  (2Fe-2S)-binding  36.02 
 
 
161 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2654  4Fe-4S binding domain protein  30.27 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0493248  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5103  oxidoreductase with iron-sulfur subunit  29.56 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.52 
 
 
486 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1024  (2Fe-2S)-binding  32.32 
 
 
165 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4603  (2Fe-2S)-binding protein  34.73 
 
 
164 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.73 
 
 
164 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.73 
 
 
164 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.11 
 
 
155 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  32.76 
 
 
280 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.03 
 
 
157 aa  94  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.3 
 
 
157 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6668  putative carbon monoxide dehydrogenase, small chain CutC  35.4 
 
 
159 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.241103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>