More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3948 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  974    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  87.63 
 
 
485 aa  842    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  87.63 
 
 
485 aa  843    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  62.81 
 
 
467 aa  593  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  60 
 
 
483 aa  569  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  61.1 
 
 
486 aa  552  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  49.6 
 
 
492 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0226  xanthine dehydrogenase, small subunit  52.37 
 
 
497 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  51.23 
 
 
493 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  48.18 
 
 
496 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  48.37 
 
 
492 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  48.17 
 
 
492 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.91 
 
 
479 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  47.49 
 
 
490 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  47.2 
 
 
484 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  46.75 
 
 
500 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.11 
 
 
484 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  48.07 
 
 
512 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  49.28 
 
 
496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.41 
 
 
484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  45.68 
 
 
484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  46.3 
 
 
484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  47.98 
 
 
543 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  47 
 
 
484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  46.65 
 
 
498 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  48.16 
 
 
488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  49.9 
 
 
488 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  48.88 
 
 
496 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  45.6 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.65 
 
 
504 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  48.66 
 
 
515 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.94 
 
 
481 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2246  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.42 
 
 
504 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  48.16 
 
 
493 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1922  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.01 
 
 
504 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.501378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.61 
 
 
542 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  47.13 
 
 
516 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.96 
 
 
487 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2300  xanthine dehydrogenase small subunit  48.43 
 
 
476 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289203  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.81 
 
 
516 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.51 
 
 
505 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5910  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.49 
 
 
537 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.79 
 
 
523 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.01 
 
 
527 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.25 
 
 
526 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.59 
 
 
528 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.79 
 
 
520 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  45.59 
 
 
528 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0799  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  47.34 
 
 
515 aa  385  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0793  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.63 
 
 
507 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3886  putative xanthine dehydrogenase  44.73 
 
 
507 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.24 
 
 
530 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  47.76 
 
 
484 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44710  xanthine dehydrogenase  47.02 
 
 
484 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  49.39 
 
 
501 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.49 
 
 
480 aa  361  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2042  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  45.98 
 
 
505 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3215  xanthine dehydrogenase  45.98 
 
 
505 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0871  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  45.98 
 
 
505 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3199  xanthine dehydrogenase family protein, iron-sulfur-binding/FAD-binding subunit  45.98 
 
 
505 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3160  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.98 
 
 
505 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2705  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  46.29 
 
 
505 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1905  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  46.29 
 
 
505 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1408  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  46.43 
 
 
592 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  39.24 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  40.54 
 
 
480 aa  335  7e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.58 
 
 
518 aa  334  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40 
 
 
506 aa  332  9e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  45.68 
 
 
467 aa  329  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.58 
 
 
507 aa  325  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.77 
 
 
512 aa  323  6e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.76 
 
 
507 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  42.36 
 
 
461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.25 
 
 
507 aa  318  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1481  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.81 
 
 
571 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0612404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.61 
 
 
467 aa  312  7.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  39.6 
 
 
499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.41 
 
 
468 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.34 
 
 
484 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1140  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37 
 
 
552 aa  278  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.578898  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.26 
 
 
514 aa  273  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.89 
 
 
490 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  32.84 
 
 
1363 aa  223  9e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.42 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.1 
 
 
450 aa  206  9e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.1 
 
 
154 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  48.65 
 
 
161 aa  136  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5970  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.92 
 
 
184 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452775  normal  0.916534 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0075  putative carbon monoxide dehydrogenase, small chain CutC  48.41 
 
 
167 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0416  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.7 
 
 
159 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.71 
 
 
157 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2152  (2Fe-2S)-binding domain protein  39.74 
 
 
164 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4544  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.86 
 
 
157 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0058  (2Fe-2S)-binding  45.57 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.325348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.3 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.45 
 
 
154 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652402  normal  0.0357628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1513  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.45 
 
 
163 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1766  (2Fe-2S)-binding  43.51 
 
 
161 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.68 
 
 
164 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.68 
 
 
164 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>