113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1559 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1559  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  100 
 
 		 202 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1578  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  97.52 
 
 		 202 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1179  Mg-chelatase subunit ChlD-like  85.64 
 
 		 202 aa  322  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1659  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  85.64 
 
 		 202 aa  322  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.774837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4808  Mg-chelatase subunit ChlD-like  89.85 
 
 		 199 aa  321  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1580  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  85.15 
 
 		 225 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.924484  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1633  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  86.8 
 
 		 198 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0312665 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2102  hypothetical protein  67.54 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1941  protoporphyrin IX magnesium chelatase  67.54 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0887  hypothetical protein  67.54 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00821077  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1611  Mg-chelatase subunit ChlD  67.54 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.193118  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1957  protoporphyrin IX magnesium chelatase  67.54 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0273  putative magnesium chelatase  67.02 
 
 		 204 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0735545  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2405  magnesium-chelatase subunit D/I family protein  69.11 
 
 		 204 aa  224  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5003  hypothetical protein  59.79 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000123501  hitchhiker  0.0000143194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1644  hypothetical protein  62.79 
 
 		 175 aa  207  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000465532  normal  0.0268751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3150  magnesium chelatase subunit ChlD  58.42 
 
 		 215 aa  204  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5744  hypothetical protein  44.36 
 
 		 153 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  hitchhiker  0.0000337383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2222  magnesium chelatase subunit ChlD  36.84 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3013  magnesium chelatase subunit ChlD  31.22 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.586709  normal  0.907591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3147  hypothetical protein  31.66 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26000  putative magnesium chelatase  33.69 
 
 		 214 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203244  normal  0.298809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4584  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  33.92 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3096  magnesium chelatase subunit ChlD  30.69 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  29.94 
 
 		 594 aa  78.2  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3505  hypothetical protein  32.29 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0313202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2271  hypothetical protein  32.29 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13850  Mg-chelatase subunit ChlD  32.05 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  36.49 
 
 		 657 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2771  hypothetical protein  32.07 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2424  hypothetical protein  31.25 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.076736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.12 
 
 		 688 aa  68.6  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.71 
 
 		 616 aa  65.1  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  32.77 
 
 		 637 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  28.72 
 
 		 660 aa  62.8  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.23 
 
 		 674 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.46 
 
 		 673 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.53 
 
 		 622 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.11 
 
 		 653 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.53 
 
 		 622 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.53 
 
 		 622 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  31.95 
 
 		 699 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  30.93 
 
 		 713 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.45 
 
 		 674 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  28.99 
 
 		 614 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  26.09 
 
 		 612 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.19 
 
 		 788 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  27.61 
 
 		 689 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  30.22 
 
 		 617 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  34.86 
 
 		 618 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  32.23 
 
 		 705 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  36.67 
 
 		 727 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  32.75 
 
 		 738 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  32.18 
 
 		 730 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  33.85 
 
 		 719 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  34.45 
 
 		 725 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  31.13 
 
 		 619 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  36.67 
 
 		 721 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  29.5 
 
 		 680 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  36.67 
 
 		 711 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.41 
 
 		 665 aa  55.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  28.57 
 
 		 717 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  33.03 
 
 		 629 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.06 
 
 		 701 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  28.06 
 
 		 717 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.11 
 
 		 703 aa  52.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.56 
 
 		 714 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  26.8 
 
 		 329 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  33.03 
 
 		 776 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  28.81 
 
 		 680 aa  52.4  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.95 
 
 		 672 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  30.84 
 
 		 696 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.43 
 
 		 677 aa  52.4  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.54 
 
 		 673 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.54 
 
 		 673 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  32.11 
 
 		 638 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  33.33 
 
 		 690 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  31.25 
 
 		 587 aa  51.6  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  32.11 
 
 		 626 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4482  von Willebrand factor type A  23.84 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  34.17 
 
 		 580 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  29.23 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  36.67 
 
 		 605 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.89 
 
 		 671 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  25.13 
 
 		 668 aa  48.9  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.95 
 
 		 664 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.16 
 
 		 678 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  31.13 
 
 		 690 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.33 
 
 		 619 aa  48.9  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  22.46 
 
 		 669 aa  48.5  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  28.57 
 
 		 670 aa  48.5  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.92 
 
 		 608 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.22 
 
 		 620 aa  48.1  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.5 
 
 		 619 aa  48.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.22 
 
 		 618 aa  48.1  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  32.82 
 
 		 800 aa  48.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  27.52 
 
 		 653 aa  47.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.5 
 
 		 618 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.17 
 
 		 636 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.5 
 
 		 621 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>