105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3096 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3096  magnesium chelatase subunit ChlD  100 
 
 		 187 aa  370  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3147  hypothetical protein  70.11 
 
 		 203 aa  255  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3013  magnesium chelatase subunit ChlD  67.91 
 
 		 195 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.586709  normal  0.907591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26000  putative magnesium chelatase  62.57 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203244  normal  0.298809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2771  hypothetical protein  60.99 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2271  hypothetical protein  59.46 
 
 		 196 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3505  hypothetical protein  59.89 
 
 		 196 aa  213  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0313202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2424  hypothetical protein  58.29 
 
 		 188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.076736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2222  magnesium chelatase subunit ChlD  60.87 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4584  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  60.96 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1580  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  32.26 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.924484  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  33.76 
 
 		 594 aa  82.4  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1179  Mg-chelatase subunit ChlD-like  32.31 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1659  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  32.31 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.774837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4808  Mg-chelatase subunit ChlD-like  32.49 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1633  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  32.31 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0312665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5744  hypothetical protein  39.1 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  hitchhiker  0.0000337383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  31.89 
 
 		 614 aa  77.8  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1644  hypothetical protein  36.81 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000465532  normal  0.0268751 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0273  putative magnesium chelatase  34.83 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0735545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1611  Mg-chelatase subunit ChlD  34.22 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.193118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1941  protoporphyrin IX magnesium chelatase  34.22 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1957  protoporphyrin IX magnesium chelatase  34.22 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0887  hypothetical protein  34.22 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00821077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  33.91 
 
 		 657 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2102  hypothetical protein  34.22 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5003  hypothetical protein  35.8 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000123501  hitchhiker  0.0000143194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1559  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  30.69 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 699 aa  71.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  31.44 
 
 		 705 aa  71.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.88 
 
 		 653 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  34.48 
 
 		 674 aa  69.3  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1578  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  30.16 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2405  magnesium-chelatase subunit D/I family protein  32.62 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  31.05 
 
 		 713 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.33 
 
 		 673 aa  62.8  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  32.18 
 
 		 738 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  31.79 
 
 		 719 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.71 
 
 		 616 aa  61.2  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  31.18 
 
 		 637 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3150  magnesium chelatase subunit ChlD  32.14 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25 
 
 		 688 aa  58.9  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  32.3 
 
 		 730 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  29.44 
 
 		 680 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  29.21 
 
 		 619 aa  55.1  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.6 
 
 		 674 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  28.26 
 
 		 660 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  30.16 
 
 		 617 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  30.36 
 
 		 690 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.92 
 
 		 674 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  27.27 
 
 		 776 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.39 
 
 		 620 aa  51.6  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.4 
 
 		 672 aa  51.2  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.53 
 
 		 671 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.92 
 
 		 677 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.64 
 
 		 788 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.39 
 
 		 619 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.66 
 
 		 618 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  30.84 
 
 		 680 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  28.12 
 
 		 664 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13850  Mg-chelatase subunit ChlD  25.75 
 
 		 257 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.64 
 
 		 621 aa  49.7  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  28.65 
 
 		 670 aa  49.3  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.67 
 
 		 665 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.97 
 
 		 673 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.97 
 
 		 673 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.75 
 
 		 703 aa  48.5  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  27.42 
 
 		 619 aa  48.5  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.11 
 
 		 618 aa  48.5  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.64 
 
 		 618 aa  48.9  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.65 
 
 		 678 aa  48.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.75 
 
 		 701 aa  48.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  29.93 
 
 		 714 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  27.23 
 
 		 612 aa  47.8  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  24.4 
 
 		 643 aa  47.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.93 
 
 		 622 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.93 
 
 		 622 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.93 
 
 		 622 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0124  von Willebrand factor type A  27.07 
 
 		 272 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00784287  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  27.75 
 
 		 717 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  24.86 
 
 		 689 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  28.04 
 
 		 717 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  27.23 
 
 		 690 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  34.43 
 
 		 719 aa  45.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  24.74 
 
 		 725 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  32.5 
 
 		 605 aa  45.1  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  29.26 
 
 		 653 aa  45.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.4 
 
 		 668 aa  45.1  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  25.99 
 
 		 721 aa  44.7  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  28.16 
 
 		 618 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  24.48 
 
 		 727 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 		 329 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2350  magnesium chelatase, ChlI subunit  28.07 
 
 		 566 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.252625  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  28.1 
 
 		 637 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  25.13 
 
 		 711 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.23 
 
 		 600 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.55 
 
 		 610 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  28.1 
 
 		 637 aa  42.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  26.84 
 
 		 650 aa  42.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.55 
 
 		 608 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>