116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0273 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0273  putative magnesium chelatase  100 
 
 
204 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0735545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1611  Mg-chelatase subunit ChlD  99.51 
 
 
204 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.193118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1941  protoporphyrin IX magnesium chelatase  99.51 
 
 
207 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1957  protoporphyrin IX magnesium chelatase  99.51 
 
 
204 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0887  hypothetical protein  99.51 
 
 
207 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00821077  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2102  hypothetical protein  99.02 
 
 
206 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2405  magnesium-chelatase subunit D/I family protein  94.12 
 
 
204 aa  340  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5003  hypothetical protein  65.8 
 
 
198 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000123501  hitchhiker  0.0000143194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4808  Mg-chelatase subunit ChlD-like  68.04 
 
 
199 aa  235  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1179  Mg-chelatase subunit ChlD-like  67.02 
 
 
202 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1659  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  67.02 
 
 
202 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.774837  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1580  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  65.45 
 
 
225 aa  231  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.924484  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1559  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  66.49 
 
 
202 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1578  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  65.98 
 
 
202 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1633  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  66.49 
 
 
198 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312665 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3150  magnesium chelatase subunit ChlD  58.85 
 
 
215 aa  217  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1644  hypothetical protein  64.91 
 
 
175 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000465532  normal  0.0268751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5744  hypothetical protein  48.12 
 
 
153 aa  121  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  hitchhiker  0.0000337383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2222  magnesium chelatase subunit ChlD  39.89 
 
 
214 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3147  hypothetical protein  33.16 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3013  magnesium chelatase subunit ChlD  33.9 
 
 
195 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.586709  normal  0.907591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26000  putative magnesium chelatase  37.08 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203244  normal  0.298809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4584  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  36.09 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3505  hypothetical protein  34.48 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0313202  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3096  magnesium chelatase subunit ChlD  34.83 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2271  hypothetical protein  34.48 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2771  hypothetical protein  33.91 
 
 
214 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  27.81 
 
 
594 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  33.33 
 
 
617 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2424  hypothetical protein  32.37 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.076736  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  32.11 
 
 
657 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.23 
 
 
688 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  33.71 
 
 
637 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  26.54 
 
 
612 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.66 
 
 
653 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  30.77 
 
 
680 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.57 
 
 
674 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  27.08 
 
 
669 aa  62  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13850  Mg-chelatase subunit ChlD  29.46 
 
 
257 aa  61.6  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.68 
 
 
616 aa  61.6  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  30.94 
 
 
629 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  29.73 
 
 
614 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  29.6 
 
 
619 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  31.06 
 
 
329 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  29.82 
 
 
719 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.21 
 
 
622 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.21 
 
 
622 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.21 
 
 
622 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  29.6 
 
 
680 aa  59.3  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  30.1 
 
 
776 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  37.88 
 
 
605 aa  58.2  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  29.71 
 
 
705 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  32.96 
 
 
738 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  32.77 
 
 
713 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  35.14 
 
 
696 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4482  von Willebrand factor type A  25.25 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  30.43 
 
 
654 aa  56.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  32.96 
 
 
730 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.61 
 
 
674 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  30.47 
 
 
638 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  30.06 
 
 
699 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  30.32 
 
 
660 aa  55.1  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  34.96 
 
 
580 aa  55.1  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  30.41 
 
 
626 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.33 
 
 
672 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  30.57 
 
 
749 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.12 
 
 
673 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.12 
 
 
673 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.43 
 
 
725 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.33 
 
 
677 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.94 
 
 
788 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  31.01 
 
 
690 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.72 
 
 
610 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.41 
 
 
690 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  29.6 
 
 
670 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.37 
 
 
665 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.47 
 
 
671 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.23 
 
 
701 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.43 
 
 
714 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.94 
 
 
608 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  31.22 
 
 
674 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  32 
 
 
587 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.77 
 
 
664 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  33.33 
 
 
717 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.23 
 
 
703 aa  52.4  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.43 
 
 
727 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  33.33 
 
 
717 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.43 
 
 
721 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.43 
 
 
711 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3503  magnesium chelatase subunit D  35.2 
 
 
573 aa  51.6  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457147  normal  0.553977 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.61 
 
 
621 aa  51.6  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  30.77 
 
 
800 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  33.58 
 
 
754 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  32 
 
 
618 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.75 
 
 
678 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.43 
 
 
668 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.54 
 
 
636 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.61 
 
 
619 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  29.6 
 
 
683 aa  49.7  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
265 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>