86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2271 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2271  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3505  hypothetical protein  98.98 
 
 
196 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0313202  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2424  hypothetical protein  93.09 
 
 
188 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.076736  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2771  hypothetical protein  81.63 
 
 
214 aa  317  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3147  hypothetical protein  62.56 
 
 
203 aa  244  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3013  magnesium chelatase subunit ChlD  60 
 
 
195 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.586709  normal  0.907591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3096  magnesium chelatase subunit ChlD  59.46 
 
 
187 aa  214  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26000  putative magnesium chelatase  58.85 
 
 
214 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203244  normal  0.298809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2222  magnesium chelatase subunit ChlD  58.55 
 
 
214 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4584  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  58.95 
 
 
213 aa  191  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  29.95 
 
 
594 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1659  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  32.28 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.774837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1179  Mg-chelatase subunit ChlD-like  32.28 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0273  putative magnesium chelatase  34.08 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0735545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0887  hypothetical protein  33.51 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00821077  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1957  protoporphyrin IX magnesium chelatase  33.51 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1941  protoporphyrin IX magnesium chelatase  33.51 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1611  Mg-chelatase subunit ChlD  33.51 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.193118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1633  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  32.28 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312665 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2102  hypothetical protein  32.98 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4808  Mg-chelatase subunit ChlD-like  32.28 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1580  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  31.4 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.924484  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1559  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  32.29 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  32.58 
 
 
657 aa  72  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  31.94 
 
 
705 aa  69.3  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  26.89 
 
 
614 aa  68.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.65 
 
 
653 aa  68.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  33.91 
 
 
719 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2405  magnesium-chelatase subunit D/I family protein  32.07 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1578  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  31.25 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5744  hypothetical protein  36.84 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  hitchhiker  0.0000337383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  29.89 
 
 
699 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  32.02 
 
 
738 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  32.02 
 
 
730 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.34 
 
 
688 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1644  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000465532  normal  0.0268751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3150  magnesium chelatase subunit ChlD  33.33 
 
 
215 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  30.34 
 
 
713 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.33 
 
 
616 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5003  hypothetical protein  31.41 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000123501  hitchhiker  0.0000143194 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  28.65 
 
 
660 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.8 
 
 
673 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.58 
 
 
619 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  30.69 
 
 
674 aa  58.5  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.5 
 
 
620 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  25 
 
 
619 aa  57.4  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.16 
 
 
618 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13850  Mg-chelatase subunit ChlD  27.22 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  27.75 
 
 
612 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  28.87 
 
 
776 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30 
 
 
674 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  26.56 
 
 
617 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4482  von Willebrand factor type A  27.08 
 
 
226 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.69 
 
 
622 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.69 
 
 
622 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.69 
 
 
622 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  28.26 
 
 
680 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.07 
 
 
788 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  25.63 
 
 
618 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  24.79 
 
 
621 aa  53.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  25 
 
 
618 aa  51.6  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0124  von Willebrand factor type A  24.41 
 
 
272 aa  51.6  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00784287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  24.06 
 
 
689 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  27.46 
 
 
650 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  25.67 
 
 
670 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  25.51 
 
 
653 aa  48.9  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  21.2 
 
 
643 aa  48.9  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.79 
 
 
610 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.8 
 
 
664 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.84 
 
 
674 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  28.49 
 
 
637 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.72 
 
 
608 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  29.44 
 
 
629 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  27.64 
 
 
680 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  29.22 
 
 
690 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  30.36 
 
 
605 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  20.56 
 
 
619 aa  45.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  24.86 
 
 
671 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  25.95 
 
 
626 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  29.26 
 
 
265 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.16 
 
 
672 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  31.2 
 
 
749 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.23 
 
 
665 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  30.43 
 
 
754 aa  42.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  26.83 
 
 
637 aa  42.4  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  26.83 
 
 
637 aa  42.4  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>