More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0281 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0281  putative threonine dehydratase  100 
 
 
169 aa  340  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846695  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1315  threonine dehydratase  100 
 
 
169 aa  340  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.466157  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1809  threonine dehydratase  100 
 
 
535 aa  314  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  98.73 
 
 
535 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0284  threonine dehydratase  98.73 
 
 
535 aa  309  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1144  threonine dehydratase  90.45 
 
 
535 aa  278  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0840  threonine dehydratase  95.2 
 
 
507 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2312  threonine dehydratase  94.4 
 
 
507 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0677  threonine dehydratase  94.4 
 
 
507 aa  238  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  94.4 
 
 
507 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  94.4 
 
 
507 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2766  threonine dehydratase  94.4 
 
 
507 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0662  threonine dehydratase  94.4 
 
 
507 aa  237  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  93.6 
 
 
507 aa  236  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0370  threonine dehydratase  90.4 
 
 
507 aa  229  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  92 
 
 
507 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  91.2 
 
 
507 aa  227  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  91.2 
 
 
507 aa  227  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2654  threonine dehydratase  90.4 
 
 
507 aa  226  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2787  threonine dehydratase  90.4 
 
 
507 aa  226  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  91.2 
 
 
507 aa  225  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  90.4 
 
 
507 aa  225  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  87.2 
 
 
524 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4054  threonine dehydratase  87.2 
 
 
535 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  86.4 
 
 
524 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0645  threonine dehydratase  86.4 
 
 
507 aa  216  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.701109  normal  0.544724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4909  threonine dehydratase  75.19 
 
 
527 aa  203  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5602  putative threonine dehydratase  76.98 
 
 
363 aa  197  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1900  threonine dehydratase, biosynthetic  74.4 
 
 
506 aa  190  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1605  threonine dehydratase, biosynthetic  72.8 
 
 
506 aa  188  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.677814  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  71.2 
 
 
507 aa  181  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  72 
 
 
506 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  70.4 
 
 
506 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0354  threonine dehydratase  63.19 
 
 
565 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0413  threonine dehydratase  66.4 
 
 
519 aa  175  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  71.77 
 
 
501 aa  175  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  68 
 
 
529 aa  173  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  62.33 
 
 
549 aa  172  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  66.18 
 
 
527 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  68.8 
 
 
507 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  68 
 
 
517 aa  164  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  67.2 
 
 
502 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0743  threonine dehydratase  64.8 
 
 
519 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0658  threonine dehydratase  66.4 
 
 
520 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0435798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0679  threonine dehydratase  66.4 
 
 
520 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0606689  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  62.6 
 
 
606 aa  163  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  64.8 
 
 
526 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  64.06 
 
 
565 aa  162  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  64.57 
 
 
509 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  65.6 
 
 
515 aa  159  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  62.7 
 
 
509 aa  159  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  62.2 
 
 
514 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  63.78 
 
 
503 aa  157  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  61.6 
 
 
510 aa  155  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  64.8 
 
 
503 aa  154  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  62.4 
 
 
512 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  59.52 
 
 
504 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  58.73 
 
 
504 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  58.73 
 
 
504 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  58.73 
 
 
504 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1311  threonine dehydratase, biosynthetic  60.8 
 
 
503 aa  151  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.484078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  64.1 
 
 
504 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  64.1 
 
 
504 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  61.42 
 
 
512 aa  150  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  64.04 
 
 
504 aa  150  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  57.94 
 
 
504 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  57.14 
 
 
504 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  62.99 
 
 
506 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  60.63 
 
 
505 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  62.99 
 
 
506 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  58.73 
 
 
511 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  59.23 
 
 
514 aa  148  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  61.54 
 
 
504 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  64.1 
 
 
504 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  53.64 
 
 
550 aa  147  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  62.28 
 
 
511 aa  147  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  60.32 
 
 
510 aa  147  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  64.96 
 
 
515 aa  147  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  60.48 
 
 
506 aa  147  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  60.63 
 
 
509 aa  147  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  59.84 
 
 
510 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4249  threonine dehydratase, biosynthetic  58.06 
 
 
516 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.423735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  57.94 
 
 
514 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  56.35 
 
 
511 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  56.35 
 
 
511 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  58.54 
 
 
501 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  60.32 
 
 
505 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  57.14 
 
 
514 aa  144  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  60.48 
 
 
523 aa  144  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0627  threonine dehydratase, biosynthetic  57.48 
 
 
509 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.554958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  62.39 
 
 
514 aa  143  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09511  threonine dehydratase  55.04 
 
 
513 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.350493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  57.14 
 
 
507 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09531  threonine dehydratase  55.04 
 
 
513 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  57.94 
 
 
503 aa  141  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0892  threonine dehydratase  52.71 
 
 
515 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  54.33 
 
 
516 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  58.54 
 
 
507 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0359  threonine dehydratase  53.57 
 
 
547 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  48.45 
 
 
545 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>