More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4896 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4896  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645531  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3150  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.14204 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2751  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301483  normal  0.376747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1977 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  32.28 
 
 		 258 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  33.85 
 
 		 228 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 229 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 1274 aa  84  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  32.56 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  33.06 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  33.07 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  32.48 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.77 
 
 		 231 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  33.06 
 
 		 260 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  31.5 
 
 		 265 aa  80.5  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  31.5 
 
 		 265 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0599  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.44338  hitchhiker  0.0000000000672903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  31.5 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  31.62 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  31.62 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 1352 aa  79  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  32.77 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  32.26 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  32.26 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  32.8 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  32.48 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  30 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  30.77 
 
 		 228 aa  77  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.8 
 
 		 231 aa  77  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  39.29 
 
 		 460 aa  76.3  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  32.79 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  27.35 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  30.51 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  35.58 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  31.2 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.5 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1775  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 510 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.67 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 313 aa  74.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.59 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.67 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4099  histidine kinase  32.48 
 
 		 600 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  decreased coverage  0.000691518 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.52 
 
 		 941 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1362 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 970 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  29.03 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  34.62 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  29.66 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 823 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2052  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.69 
 
 		 481 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 		 263 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2076  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.69 
 
 		 481 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00773841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0821  two component transcriptional regulator  29.75 
 
 		 232 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 257 aa  74.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 328 aa  73.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.28 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.45 
 
 		 469 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 247 aa  73.6  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>