More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3006 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3006  lipoyl synthase  100 
 
 
305 aa  632  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  79.19 
 
 
304 aa  507  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1107  lipoyl synthase  77.36 
 
 
302 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  76.82 
 
 
300 aa  477  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  76.47 
 
 
300 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3493  lipoyl synthase  74.09 
 
 
307 aa  468  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  74.3 
 
 
307 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1507  lipoyl synthase  68.64 
 
 
311 aa  419  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.610333  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1398  lipoyl synthase  64.46 
 
 
299 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1638  lipoyl synthase  64.46 
 
 
299 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09741  lipoyl synthase  63.32 
 
 
306 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14841  lipoyl synthase  58.95 
 
 
307 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0652  lipoyl synthase  58.6 
 
 
307 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.143866  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10901  lipoyl synthase  58.89 
 
 
306 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.241228 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12031  lipoyl synthase  57.19 
 
 
299 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11871  lipoyl synthase  57.24 
 
 
299 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12021  lipoyl synthase  57.19 
 
 
299 aa  354  8.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1107  lipoyl synthase  56.51 
 
 
299 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.772098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  49.66 
 
 
298 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  50.89 
 
 
318 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  49.32 
 
 
298 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  49.32 
 
 
298 aa  295  8e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  49.32 
 
 
298 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  49.32 
 
 
298 aa  295  8e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  49.32 
 
 
298 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  49.32 
 
 
298 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  49.32 
 
 
298 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  48.97 
 
 
298 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  48.97 
 
 
298 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  48.97 
 
 
298 aa  292  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  50 
 
 
288 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  50.7 
 
 
324 aa  289  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  48.14 
 
 
304 aa  288  8e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  51.41 
 
 
321 aa  287  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  50.89 
 
 
309 aa  286  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  48.97 
 
 
298 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  48.24 
 
 
320 aa  285  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  47.46 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  47.46 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  49.47 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  51.06 
 
 
303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  48.4 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  51.06 
 
 
303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  48.41 
 
 
282 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  48.4 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  50.35 
 
 
325 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  48.94 
 
 
321 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  48.62 
 
 
308 aa  280  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  50 
 
 
296 aa  276  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  45.99 
 
 
314 aa  276  4e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  47.22 
 
 
337 aa  275  5e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  48.95 
 
 
325 aa  275  7e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  47.28 
 
 
336 aa  275  8e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  49.29 
 
 
328 aa  275  9e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  47.65 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  48.59 
 
 
304 aa  272  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  47.89 
 
 
297 aa  272  6e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  47.35 
 
 
292 aa  272  6e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  49.11 
 
 
291 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  45.55 
 
 
326 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  48.94 
 
 
325 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  45.55 
 
 
326 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  47.54 
 
 
287 aa  270  2e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  47.72 
 
 
294 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  45.7 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  47.54 
 
 
321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  45.61 
 
 
373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  45.61 
 
 
373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  46.64 
 
 
306 aa  269  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  50.36 
 
 
276 aa  269  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  45.7 
 
 
318 aa  269  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  44.18 
 
 
320 aa  269  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3030  lipoyl synthase  45.67 
 
 
322 aa  268  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.464318  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  44.83 
 
 
338 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  44.83 
 
 
338 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  46.71 
 
 
322 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  46.88 
 
 
329 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  44.48 
 
 
338 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  47.02 
 
 
291 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  44.86 
 
 
332 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  44.48 
 
 
338 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  45.42 
 
 
355 aa  267  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  44.64 
 
 
321 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  45.67 
 
 
321 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  48.06 
 
 
283 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  47.89 
 
 
320 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  45.95 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  46.37 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  46.37 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  46.37 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  45.17 
 
 
317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  48.4 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  45.17 
 
 
322 aa  266  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  47.72 
 
 
289 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  47.18 
 
 
351 aa  265  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  45.99 
 
 
337 aa  265  8e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  47.16 
 
 
331 aa  265  8e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  47.42 
 
 
317 aa  265  8.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  49.3 
 
 
319 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  44.63 
 
 
334 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>