More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_09741 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_09741  lipoyl synthase  100 
 
 
306 aa  634    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1398  lipoyl synthase  77.85 
 
 
299 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1638  lipoyl synthase  77.85 
 
 
299 aa  485  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10901  lipoyl synthase  68.85 
 
 
306 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.241228 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14841  lipoyl synthase  70.27 
 
 
307 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0652  lipoyl synthase  69.93 
 
 
307 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.143866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1507  lipoyl synthase  66.09 
 
 
311 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.610333  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  62.2 
 
 
307 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1107  lipoyl synthase  62.15 
 
 
302 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  59.41 
 
 
300 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3006  lipoyl synthase  61.46 
 
 
305 aa  378  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11871  lipoyl synthase  58.89 
 
 
299 aa  377  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  59.08 
 
 
300 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12031  lipoyl synthase  58.19 
 
 
299 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3493  lipoyl synthase  59.66 
 
 
307 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12021  lipoyl synthase  58.19 
 
 
299 aa  360  1e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1107  lipoyl synthase  57.49 
 
 
299 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.772098  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  56.95 
 
 
304 aa  358  8e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  49.13 
 
 
318 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  48.61 
 
 
288 aa  282  5.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  46.03 
 
 
298 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  45.36 
 
 
298 aa  279  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  45.36 
 
 
298 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  45.36 
 
 
298 aa  279  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  45.36 
 
 
298 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  45.36 
 
 
298 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  45.36 
 
 
298 aa  278  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  45.7 
 
 
298 aa  278  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  45.36 
 
 
298 aa  278  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  45.36 
 
 
298 aa  278  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  45.36 
 
 
298 aa  278  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  50.17 
 
 
317 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  51.9 
 
 
324 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  50.17 
 
 
317 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  48.95 
 
 
315 aa  276  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  47.74 
 
 
308 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  48.95 
 
 
315 aa  276  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  46.55 
 
 
298 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  48.15 
 
 
320 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  48.95 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  47.39 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  46.55 
 
 
298 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  47.75 
 
 
283 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  47.59 
 
 
337 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  45.79 
 
 
338 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  45.79 
 
 
338 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  45.45 
 
 
338 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  47.4 
 
 
336 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  44.88 
 
 
320 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  45.8 
 
 
291 aa  267  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  45.45 
 
 
340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  47.89 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  47.62 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  45.24 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  47.62 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  47.28 
 
 
373 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  47.06 
 
 
306 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  47.89 
 
 
314 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  47.28 
 
 
373 aa  265  5e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  45.12 
 
 
338 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  45.12 
 
 
323 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  45.12 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  44.37 
 
 
315 aa  265  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  47.81 
 
 
321 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  43.69 
 
 
314 aa  265  8.999999999999999e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  48.08 
 
 
321 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  48.43 
 
 
294 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  43.45 
 
 
304 aa  264  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  45.99 
 
 
335 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  46.71 
 
 
304 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  48.25 
 
 
297 aa  263  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  44.37 
 
 
326 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  48.11 
 
 
322 aa  263  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  45.33 
 
 
355 aa  263  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  44.55 
 
 
320 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  45.52 
 
 
322 aa  262  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  46.34 
 
 
318 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  44.33 
 
 
327 aa  262  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  46.53 
 
 
321 aa  262  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  46.53 
 
 
327 aa  262  6e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  44.37 
 
 
321 aa  261  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  45.17 
 
 
317 aa  261  6.999999999999999e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  47.39 
 
 
321 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  44.75 
 
 
330 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  47.57 
 
 
296 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  45.15 
 
 
325 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  47.02 
 
 
325 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  44.12 
 
 
329 aa  260  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  47.39 
 
 
321 aa  260  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  46.8 
 
 
321 aa  259  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  46.53 
 
 
321 aa  259  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  46.53 
 
 
321 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  45.27 
 
 
300 aa  259  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  44.86 
 
 
314 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  43.99 
 
 
357 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  46.74 
 
 
328 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  46.53 
 
 
321 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  46.21 
 
 
326 aa  259  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  45.64 
 
 
299 aa  259  4e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  43.2 
 
 
315 aa  259  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>