More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3493 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3493  lipoyl synthase  100 
 
 
307 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  75.09 
 
 
300 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  75.43 
 
 
300 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1107  lipoyl synthase  73.36 
 
 
302 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3006  lipoyl synthase  72.76 
 
 
305 aa  462  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  71.05 
 
 
304 aa  454  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  72.35 
 
 
307 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1507  lipoyl synthase  67.12 
 
 
311 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.610333  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1398  lipoyl synthase  65.42 
 
 
299 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1638  lipoyl synthase  61.15 
 
 
299 aa  381  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14841  lipoyl synthase  58.31 
 
 
307 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09741  lipoyl synthase  59.66 
 
 
306 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0652  lipoyl synthase  57.97 
 
 
307 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.143866  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10901  lipoyl synthase  57.63 
 
 
306 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.241228 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11871  lipoyl synthase  53.62 
 
 
299 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12031  lipoyl synthase  52.63 
 
 
299 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12021  lipoyl synthase  51.82 
 
 
299 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1107  lipoyl synthase  52.15 
 
 
299 aa  319  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.772098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  49 
 
 
318 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  50.68 
 
 
321 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  48 
 
 
298 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  48.63 
 
 
320 aa  287  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  47.33 
 
 
298 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  47.33 
 
 
298 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  47.33 
 
 
298 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  47.33 
 
 
298 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  49.49 
 
 
324 aa  286  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  47.33 
 
 
298 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  47.33 
 
 
298 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  47.67 
 
 
298 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  47.33 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  47.33 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  47.33 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  48.12 
 
 
298 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  46.31 
 
 
320 aa  279  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  47.78 
 
 
298 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  48.64 
 
 
288 aa  278  9e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  48.63 
 
 
309 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  45.21 
 
 
321 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  45.21 
 
 
321 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  45.21 
 
 
321 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  45.21 
 
 
321 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  45.21 
 
 
321 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  49.31 
 
 
314 aa  275  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0238  lipoyl synthase  47.08 
 
 
294 aa  275  9e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.39899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  48.3 
 
 
296 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  46.08 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  46.58 
 
 
337 aa  273  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  48.28 
 
 
291 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  44.55 
 
 
321 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  44.55 
 
 
321 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  46.9 
 
 
315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  44.55 
 
 
321 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  47.26 
 
 
282 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  46.9 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  45.36 
 
 
321 aa  271  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  46.1 
 
 
308 aa  271  8.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  45.3 
 
 
304 aa  271  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  44.22 
 
 
321 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  47.64 
 
 
297 aa  271  1e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  44.3 
 
 
321 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  45.36 
 
 
321 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  45.36 
 
 
321 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  45.36 
 
 
321 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  45.36 
 
 
321 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  45.36 
 
 
321 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  45.36 
 
 
321 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  45.36 
 
 
321 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  45.36 
 
 
321 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  45.36 
 
 
321 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  45.7 
 
 
321 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  47.44 
 
 
283 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  44.97 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  44.97 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  44.22 
 
 
300 aa  268  7e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  48.29 
 
 
325 aa  268  8e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  44.52 
 
 
339 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  45.36 
 
 
321 aa  268  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  44.82 
 
 
318 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  45.02 
 
 
321 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  47.95 
 
 
303 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  47.95 
 
 
303 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  44.3 
 
 
321 aa  267  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  46.62 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  44 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  46.94 
 
 
328 aa  265  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  44.16 
 
 
296 aa  266  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  45.39 
 
 
337 aa  265  7e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  46.42 
 
 
297 aa  265  7e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  44.86 
 
 
311 aa  265  8e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  44.48 
 
 
348 aa  265  8e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  45.89 
 
 
304 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  43.79 
 
 
325 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  46.6 
 
 
368 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0399  lipoyl synthase  46.1 
 
 
283 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123517  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  45.27 
 
 
287 aa  263  3e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  44.59 
 
 
336 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  45.89 
 
 
351 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  45.36 
 
 
321 aa  262  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  45.24 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>