More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1398 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1398  lipoyl synthase  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1638  lipoyl synthase  85.28 
 
 
299 aa  534  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09741  lipoyl synthase  77.85 
 
 
306 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10901  lipoyl synthase  69.13 
 
 
306 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.241228 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14841  lipoyl synthase  70.27 
 
 
307 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0652  lipoyl synthase  69.93 
 
 
307 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.143866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1507  lipoyl synthase  69.62 
 
 
311 aa  419  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.610333  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  62.21 
 
 
300 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  62.54 
 
 
300 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3493  lipoyl synthase  65.42 
 
 
307 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1107  lipoyl synthase  64.81 
 
 
302 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3006  lipoyl synthase  64.11 
 
 
305 aa  394  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12031  lipoyl synthase  60.07 
 
 
299 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  62.89 
 
 
307 aa  381  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11871  lipoyl synthase  59.93 
 
 
299 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  62.94 
 
 
304 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1107  lipoyl synthase  60.63 
 
 
299 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.772098  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12021  lipoyl synthase  59.93 
 
 
299 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  51.86 
 
 
318 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  52.54 
 
 
320 aa  295  7e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  54.36 
 
 
324 aa  292  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  51.04 
 
 
298 aa  289  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  51.57 
 
 
298 aa  288  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  50.7 
 
 
315 aa  288  8e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  50.7 
 
 
315 aa  288  9e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  51.74 
 
 
288 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  50.35 
 
 
298 aa  286  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  50.35 
 
 
298 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  50.35 
 
 
298 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  50.35 
 
 
298 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  50.35 
 
 
298 aa  286  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  50.35 
 
 
298 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  50.69 
 
 
298 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  50.35 
 
 
298 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  50.35 
 
 
298 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  51.22 
 
 
298 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  50.52 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  50.52 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  50.52 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  49.65 
 
 
298 aa  285  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  49.13 
 
 
325 aa  285  7e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  50.17 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  50.35 
 
 
337 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  48.08 
 
 
304 aa  280  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  49.48 
 
 
321 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  49.66 
 
 
283 aa  279  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  49.13 
 
 
321 aa  279  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  50 
 
 
309 aa  279  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  49.13 
 
 
305 aa  279  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  49.13 
 
 
305 aa  279  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  49.13 
 
 
321 aa  278  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  50.7 
 
 
308 aa  278  7e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3030  lipoyl synthase  48.43 
 
 
322 aa  277  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.464318  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  48.83 
 
 
321 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0238  lipoyl synthase  49.12 
 
 
294 aa  277  2e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.39899  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  49.48 
 
 
321 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  49.48 
 
 
321 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  49.48 
 
 
321 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  49.48 
 
 
321 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  49.48 
 
 
321 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  48.66 
 
 
321 aa  276  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  48.63 
 
 
337 aa  276  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  49.15 
 
 
373 aa  276  4e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  49.15 
 
 
373 aa  276  4e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  49.66 
 
 
327 aa  276  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  48.78 
 
 
321 aa  275  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  49.66 
 
 
317 aa  275  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  49.66 
 
 
317 aa  275  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  49.13 
 
 
321 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  49.13 
 
 
321 aa  275  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  49.13 
 
 
321 aa  275  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  49.13 
 
 
321 aa  275  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  49.13 
 
 
321 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  49.13 
 
 
321 aa  275  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  49.13 
 
 
321 aa  275  8e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  49.13 
 
 
321 aa  275  8e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  49.13 
 
 
321 aa  275  8e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  49.13 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  47.9 
 
 
355 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  49.48 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  51.4 
 
 
322 aa  273  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  49.83 
 
 
321 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  45.79 
 
 
314 aa  273  3e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  48.43 
 
 
321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  48.78 
 
 
321 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  47.46 
 
 
338 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  47.46 
 
 
338 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  48.11 
 
 
336 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  47.12 
 
 
338 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  50 
 
 
303 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  50 
 
 
303 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3492  lipoyl synthase  46.64 
 
 
321 aa  269  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  45.64 
 
 
320 aa  269  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0692  lipoyl synthase  48.16 
 
 
321 aa  269  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  47.83 
 
 
321 aa  269  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  47.89 
 
 
282 aa  269  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  52.69 
 
 
276 aa  269  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  46.78 
 
 
340 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  46.78 
 
 
338 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  48.25 
 
 
321 aa  268  8.999999999999999e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>