More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_11871 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_11871  lipoyl synthase  100 
 
 
299 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12031  lipoyl synthase  82.27 
 
 
299 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12021  lipoyl synthase  81.94 
 
 
299 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1107  lipoyl synthase  82.27 
 
 
299 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.772098  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10901  lipoyl synthase  64.65 
 
 
306 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.241228 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1638  lipoyl synthase  59.25 
 
 
299 aa  388  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0652  lipoyl synthase  63.29 
 
 
307 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.143866  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14841  lipoyl synthase  63.64 
 
 
307 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09741  lipoyl synthase  58.89 
 
 
306 aa  377  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1398  lipoyl synthase  59.93 
 
 
299 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  57.97 
 
 
300 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  57.97 
 
 
300 aa  362  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1107  lipoyl synthase  59.31 
 
 
302 aa  359  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1507  lipoyl synthase  57.54 
 
 
311 aa  355  5.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.610333  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3006  lipoyl synthase  56.21 
 
 
305 aa  354  8.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  57.49 
 
 
307 aa  343  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  56.9 
 
 
304 aa  342  5.999999999999999e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3493  lipoyl synthase  53.62 
 
 
307 aa  333  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  48.29 
 
 
355 aa  296  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  46.05 
 
 
320 aa  278  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  44.64 
 
 
320 aa  278  9e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  44.29 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  45.42 
 
 
315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3030  lipoyl synthase  47.57 
 
 
322 aa  272  4.0000000000000004e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.464318  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  45.67 
 
 
320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  44.14 
 
 
304 aa  272  5.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  45.08 
 
 
315 aa  271  7e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  44.79 
 
 
373 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  43.69 
 
 
336 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  44.79 
 
 
373 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  45.14 
 
 
327 aa  270  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  45.61 
 
 
324 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  45.21 
 
 
305 aa  269  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  45.21 
 
 
305 aa  269  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  45.58 
 
 
308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  45.64 
 
 
340 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  44.26 
 
 
338 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  44.26 
 
 
338 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  43.92 
 
 
323 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  44.26 
 
 
338 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  44.26 
 
 
327 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  43.49 
 
 
319 aa  266  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  45.24 
 
 
329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  45.24 
 
 
329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  45.24 
 
 
329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  45.58 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  44.33 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  44.26 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  45.58 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  45.1 
 
 
306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  46.34 
 
 
288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  45.24 
 
 
329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  45.86 
 
 
298 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  45.24 
 
 
329 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  45.58 
 
 
330 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  44.26 
 
 
338 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  45.24 
 
 
329 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  45.24 
 
 
329 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  45.05 
 
 
329 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  45.24 
 
 
330 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  44.95 
 
 
335 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  44.88 
 
 
303 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  44.88 
 
 
303 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  45.77 
 
 
289 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  43.01 
 
 
325 aa  265  8e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  45.86 
 
 
298 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  43.45 
 
 
321 aa  264  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  45.58 
 
 
330 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  45.58 
 
 
330 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  44.98 
 
 
321 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  45.58 
 
 
330 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  43.71 
 
 
322 aa  263  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  44.95 
 
 
318 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  43.56 
 
 
337 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  43.24 
 
 
324 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  44.01 
 
 
294 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  45.77 
 
 
289 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  44.14 
 
 
327 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  42.71 
 
 
337 aa  261  6.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3492  lipoyl synthase  44.14 
 
 
321 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1987  lipoyl synthase  43.75 
 
 
316 aa  261  8e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  44.9 
 
 
334 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  44.9 
 
 
335 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  43.79 
 
 
321 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  44.64 
 
 
321 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  44.17 
 
 
321 aa  259  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  43.45 
 
 
321 aa  259  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  44.33 
 
 
321 aa  259  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  44.56 
 
 
334 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  44.98 
 
 
321 aa  259  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1085  lipoyl synthase  44.33 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00323584  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  44.33 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  45.23 
 
 
309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3282  lipoyl synthase  44.33 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0177206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3460  lipoyl synthase  44.33 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633504  normal  0.0256244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  45.1 
 
 
282 aa  258  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  43.45 
 
 
321 aa  258  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  44.17 
 
 
347 aa  258  8e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  44.72 
 
 
292 aa  258  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  43.58 
 
 
332 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>