More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1507 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1507  lipoyl synthase  100 
 
 		 311 aa  634    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.610333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1398  lipoyl synthase  69.62 
 
 		 299 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  68.28 
 
 		 300 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3493  lipoyl synthase  67.12 
 
 		 307 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  68.28 
 
 		 300 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3006  lipoyl synthase  68.29 
 
 		 305 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1107  lipoyl synthase  65.57 
 
 		 302 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  67.47 
 
 		 304 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1638  lipoyl synthase  68.28 
 
 		 299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  67.57 
 
 		 307 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09741  lipoyl synthase  66.09 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10901  lipoyl synthase  61.64 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.241228 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14841  lipoyl synthase  59.06 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0652  lipoyl synthase  58.72 
 
 		 307 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.143866  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11871  lipoyl synthase  57.54 
 
 		 299 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12031  lipoyl synthase  55.79 
 
 		 299 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12021  lipoyl synthase  55.44 
 
 		 299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1107  lipoyl synthase  55.44 
 
 		 299 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.772098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  54.39 
 
 		 324 aa  296  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  51.23 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  50.53 
 
 		 337 aa  285  8e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 309 aa  285  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 298 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  48.95 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  48.95 
 
 		 298 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  48.95 
 
 		 298 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  48.95 
 
 		 298 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  48.95 
 
 		 298 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  49.3 
 
 		 298 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  48.95 
 
 		 298 aa  279  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  48.95 
 
 		 298 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  48.95 
 
 		 298 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  48.6 
 
 		 355 aa  277  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 308 aa  276  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  48.6 
 
 		 298 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  51.23 
 
 		 322 aa  275  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  275  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  275  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  275  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 340 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  48.07 
 
 		 282 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  48.97 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  47.2 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  48.95 
 
 		 321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  48.97 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  47.75 
 
 		 294 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  49.12 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  47.2 
 
 		 305 aa  271  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  47.2 
 
 		 305 aa  271  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  48.25 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  49.12 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  48.42 
 
 		 291 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  48.1 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  48.25 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  47.47 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3030  lipoyl synthase  47.57 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.464318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  46.85 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 324 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  47.81 
 
 		 321 aa  269  5.9999999999999995e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  47.39 
 
 		 321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  47.93 
 
 		 321 aa  268  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  48.25 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  47.89 
 
 		 321 aa  267  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  46.85 
 
 		 287 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  47.9 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  49.3 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  48.1 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  46.55 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  47.9 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  49.82 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  46.74 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  48.77 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  49.3 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  48.59 
 
 		 311 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  47.55 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  48.08 
 
 		 317 aa  265  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  48.08 
 
 		 317 aa  265  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  48.77 
 
 		 314 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>