More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0652 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0652  lipoyl synthase  100 
 
 
307 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.143866  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14841  lipoyl synthase  98.37 
 
 
307 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10901  lipoyl synthase  72.31 
 
 
306 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.241228 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09741  lipoyl synthase  68.75 
 
 
306 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1638  lipoyl synthase  68.79 
 
 
299 aa  447  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1398  lipoyl synthase  69.46 
 
 
299 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11871  lipoyl synthase  63.29 
 
 
299 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12031  lipoyl synthase  63.29 
 
 
299 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1107  lipoyl synthase  63.99 
 
 
299 aa  374  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.772098  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1507  lipoyl synthase  58.72 
 
 
311 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.610333  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  60.35 
 
 
300 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3493  lipoyl synthase  57.97 
 
 
307 aa  371  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  60.35 
 
 
300 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12021  lipoyl synthase  63.64 
 
 
299 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1107  lipoyl synthase  59.3 
 
 
302 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3006  lipoyl synthase  58.25 
 
 
305 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  57.6 
 
 
304 aa  359  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  56.25 
 
 
307 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  48.42 
 
 
318 aa  292  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  46.15 
 
 
320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  50.7 
 
 
282 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  46.83 
 
 
321 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  48.44 
 
 
298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  46.85 
 
 
303 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  46.85 
 
 
303 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  47.55 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  47.02 
 
 
324 aa  272  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  46.5 
 
 
308 aa  271  9e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  46.48 
 
 
340 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  47.93 
 
 
298 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  45.77 
 
 
335 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  45.61 
 
 
357 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  47.92 
 
 
336 aa  268  5.9999999999999995e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  46.5 
 
 
290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  45.8 
 
 
322 aa  268  7e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  44.93 
 
 
323 aa  268  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  44.93 
 
 
327 aa  268  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  48.06 
 
 
314 aa  268  8.999999999999999e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  45.07 
 
 
338 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  48.61 
 
 
283 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  45.07 
 
 
338 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  45.07 
 
 
338 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  43.75 
 
 
325 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  46.21 
 
 
298 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  47.74 
 
 
291 aa  265  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  44.72 
 
 
338 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  47.55 
 
 
288 aa  265  5.999999999999999e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  42.96 
 
 
315 aa  265  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  45.52 
 
 
298 aa  265  7e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  45.86 
 
 
298 aa  265  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  44.14 
 
 
304 aa  265  8e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  45.42 
 
 
318 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  45.86 
 
 
298 aa  265  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  45.86 
 
 
298 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  45.86 
 
 
298 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  45.86 
 
 
298 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  45.86 
 
 
298 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  45.77 
 
 
315 aa  264  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  45.86 
 
 
298 aa  264  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  45.86 
 
 
298 aa  264  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  45.86 
 
 
298 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  47.06 
 
 
325 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  45.77 
 
 
315 aa  264  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  46.18 
 
 
337 aa  264  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  47.4 
 
 
325 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  47.37 
 
 
320 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  46.02 
 
 
321 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  45.17 
 
 
337 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  45.26 
 
 
332 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  44.52 
 
 
324 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  44.21 
 
 
292 aa  262  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  45.36 
 
 
315 aa  262  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  48.43 
 
 
321 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  45.61 
 
 
326 aa  261  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  45.3 
 
 
329 aa  261  8.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  44.21 
 
 
339 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  43.45 
 
 
305 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  46.45 
 
 
309 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  43.45 
 
 
305 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  46.34 
 
 
327 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  44.21 
 
 
318 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  45.1 
 
 
325 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  45.83 
 
 
373 aa  260  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  45.83 
 
 
373 aa  260  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  44.91 
 
 
321 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  45.77 
 
 
304 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  44.91 
 
 
332 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  44.37 
 
 
319 aa  259  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  44.03 
 
 
317 aa  259  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  44.03 
 
 
317 aa  259  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  45.26 
 
 
327 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  45.74 
 
 
314 aa  259  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1987  lipoyl synthase  45.1 
 
 
316 aa  259  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  45.55 
 
 
314 aa  259  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  46.21 
 
 
328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  45.96 
 
 
321 aa  258  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  45.26 
 
 
297 aa  258  6e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  45.67 
 
 
328 aa  258  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  44.56 
 
 
326 aa  258  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  44.56 
 
 
326 aa  258  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>