More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1107 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1107  lipoyl synthase  100 
 
 
299 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.772098  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12031  lipoyl synthase  96.66 
 
 
299 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12021  lipoyl synthase  96.99 
 
 
299 aa  580  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11871  lipoyl synthase  82.27 
 
 
299 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10901  lipoyl synthase  63.88 
 
 
306 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.241228 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14841  lipoyl synthase  64.34 
 
 
307 aa  387  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1398  lipoyl synthase  60.63 
 
 
299 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0652  lipoyl synthase  63.99 
 
 
307 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.143866  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1638  lipoyl synthase  59.23 
 
 
299 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09741  lipoyl synthase  57.49 
 
 
306 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3006  lipoyl synthase  55.82 
 
 
305 aa  355  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1107  lipoyl synthase  57.19 
 
 
302 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  55.89 
 
 
300 aa  351  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  55.89 
 
 
300 aa  351  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1507  lipoyl synthase  55.44 
 
 
311 aa  347  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.610333  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  56.08 
 
 
304 aa  344  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  56.79 
 
 
307 aa  338  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3493  lipoyl synthase  52.15 
 
 
307 aa  331  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  46.71 
 
 
318 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  47.1 
 
 
355 aa  285  9e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  45.45 
 
 
327 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  45.12 
 
 
323 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  45.05 
 
 
338 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  45.05 
 
 
338 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  45.05 
 
 
338 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  44.71 
 
 
338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  44.78 
 
 
340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  44.29 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3030  lipoyl synthase  47.26 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.464318  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  46.53 
 
 
336 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  45.1 
 
 
322 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  45.3 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  46.23 
 
 
320 aa  272  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  45.3 
 
 
373 aa  272  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  43.49 
 
 
304 aa  271  8.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  46.69 
 
 
288 aa  271  9e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  45.99 
 
 
318 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  45.3 
 
 
327 aa  270  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  45.67 
 
 
337 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  45.3 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  45.94 
 
 
308 aa  269  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  44.18 
 
 
305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  44.18 
 
 
305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  45.86 
 
 
309 aa  268  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  44.86 
 
 
321 aa  268  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  45.67 
 
 
321 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  44.88 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  44.88 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  44.52 
 
 
321 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  45.21 
 
 
320 aa  266  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  44.1 
 
 
314 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  45.8 
 
 
282 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  45.61 
 
 
321 aa  265  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  45.89 
 
 
321 aa  265  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  44.11 
 
 
325 aa  265  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  44.15 
 
 
314 aa  265  8.999999999999999e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  45.61 
 
 
324 aa  264  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  43.34 
 
 
324 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3492  lipoyl synthase  44.86 
 
 
321 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  44.72 
 
 
289 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  43 
 
 
319 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  44.41 
 
 
306 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  45.3 
 
 
329 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  45.3 
 
 
329 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  45.3 
 
 
329 aa  262  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  43.2 
 
 
321 aa  262  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0867  lipoyl synthase  45.73 
 
 
321 aa  262  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.719819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  45.3 
 
 
329 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  45.3 
 
 
329 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  45.3 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  45.3 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  44.37 
 
 
289 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1049  lipoyl synthase  45.73 
 
 
321 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710809  hitchhiker  0.0056856 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  45.3 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0692  lipoyl synthase  46.42 
 
 
321 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  44.06 
 
 
315 aa  262  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  43.24 
 
 
321 aa  262  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  43.24 
 
 
321 aa  262  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  43.24 
 
 
321 aa  262  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3324  lipoyl synthase  45.73 
 
 
321 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0295877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  45.8 
 
 
283 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  43.31 
 
 
291 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3282  lipoyl synthase  45.39 
 
 
321 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0177206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1085  lipoyl synthase  45.39 
 
 
321 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00323584  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3460  lipoyl synthase  45.39 
 
 
321 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633504  normal  0.0256244 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  44.06 
 
 
315 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  44.52 
 
 
321 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  42.56 
 
 
337 aa  261  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  43.31 
 
 
294 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  44.18 
 
 
321 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1161  lipoyl synthase  45.39 
 
 
321 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1987  lipoyl synthase  45.73 
 
 
316 aa  260  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  44.06 
 
 
296 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  45.27 
 
 
321 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0984  lipoyl synthase  45.39 
 
 
321 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.10688  normal  0.0219109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0988  lipoyl synthase  45.39 
 
 
321 aa  260  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0584288  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  43.24 
 
 
321 aa  259  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  43.84 
 
 
321 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  44.71 
 
 
321 aa  259  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  43.46 
 
 
304 aa  259  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>