More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4943 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4943  Survival protein SurE  100 
 
 		 243 aa  467  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000261031  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0948  survival protein SurE  46.59 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.975237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3494  Survival protein SurE  46.72 
 
 		 278 aa  148  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2766  Survival protein SurE  43.85 
 
 		 257 aa  138  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0852  Survival protein SurE  41.21 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00830866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  30.96 
 
 		 252 aa  101  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  31.4 
 
 		 277 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  37.55 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  36.07 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  34.55 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  34.96 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  31.35 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  34.71 
 
 		 269 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  32.4 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  34.41 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  33.74 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  36.93 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  36.93 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  36.93 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0405  stationary-phase survival protein SurE  39.66 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  37.99 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  35.27 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  31.87 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  39.33 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  39.34 
 
 		 259 aa  91.7  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  33.2 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  36.16 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  37.97 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  34.83 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  32.81 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  33.06 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  36.42 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0797  stationary phase survival protein SurE  38.07 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000405923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  33.06 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  36 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  29.65 
 
 		 269 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  39.23 
 
 		 250 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  39.23 
 
 		 250 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  40.46 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  39.88 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  34.96 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  34.02 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  36.72 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  34.76 
 
 		 252 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  32.81 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  39.89 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  32.64 
 
 		 252 aa  88.6  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  34.13 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  36.16 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  39.33 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_703  stationary-phase survival protein  36.11 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000177307  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  34.86 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  38.33 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  30.99 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  34.6 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  34.86 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  30.99 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  32.64 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  32.18 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  32.18 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  35.03 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  31.12 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  32.93 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  32.02 
 
 		 269 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  38.42 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 		 253 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  37.86 
 
 		 265 aa  85.9  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  32.78 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  32.78 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  32.93 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1643  stationary-phase survival protein SurE  38.42 
 
 		 258 aa  85.1  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  32.78 
 
 		 248 aa  85.1  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  40.57 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  36 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  33.91 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  35.37 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  35.47 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  35.23 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  33.61 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  36.52 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  34.96 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  32.17 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  34.84 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2782  stationary phase survival protein SurE  30.49 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>