More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2766 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2766  Survival protein SurE  100 
 
 
257 aa  494  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3494  Survival protein SurE  57.03 
 
 
278 aa  232  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4943  Survival protein SurE  43.85 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000261031  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0948  survival protein SurE  46.64 
 
 
261 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.975237 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  37.04 
 
 
250 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  37.04 
 
 
250 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  37.68 
 
 
251 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  32.86 
 
 
246 aa  104  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  37.57 
 
 
273 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  36.06 
 
 
249 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0852  Survival protein SurE  40.4 
 
 
260 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00830866  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  32.92 
 
 
257 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  38.83 
 
 
255 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0926  stationary phase survival protein SurE  39.89 
 
 
256 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  33.61 
 
 
259 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  33.5 
 
 
252 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  34.71 
 
 
254 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  33.66 
 
 
249 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  34.15 
 
 
249 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  34.71 
 
 
254 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  34.71 
 
 
254 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  38.05 
 
 
251 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  32.35 
 
 
249 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  35.68 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  30.41 
 
 
255 aa  99.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  39.13 
 
 
259 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  34.41 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  34.41 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  34.41 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  34.41 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  34.41 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  34.41 
 
 
255 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  34.41 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  34.41 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  34.41 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  32.94 
 
 
255 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  37.37 
 
 
279 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  33 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  34.47 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  32.94 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  32.94 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  32.94 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  38.59 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  35.41 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  35.98 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  38.95 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  40.32 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  39.58 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  37.63 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  31.85 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  34.4 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  37.43 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1304  stationary-phase survival protein SurE  35.89 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  35.6 
 
 
265 aa  95.1  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  32.55 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  36.45 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  33.85 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  34.8 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  34.03 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  35.48 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  33.85 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  37.44 
 
 
251 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
251 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  38.3 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  34.57 
 
 
255 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  37.71 
 
 
259 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  38.59 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  31.4 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  34.04 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  35.26 
 
 
254 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  35.64 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  36.45 
 
 
251 aa  93.2  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  38.04 
 
 
253 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  36.65 
 
 
254 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  33.49 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  36.17 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  35.19 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  36.65 
 
 
255 aa  92.8  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  31.58 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  35.33 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  38.59 
 
 
253 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 
253 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  36.32 
 
 
269 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 
256 aa  92.4  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  33.7 
 
 
255 aa  92  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  34.47 
 
 
249 aa  92  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  35.96 
 
 
253 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  38.04 
 
 
251 aa  92  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  37.36 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  38.24 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  37.43 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  36.7 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  36.7 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  34.55 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>