47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3609 on replicon NC_009471
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2935  TonB-dependent receptor  57.91 
 
 		 801 aa  903    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3609  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 819 aa  1648    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.396824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2551  TonB-dependent receptor  59.4 
 
 		 777 aa  899    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0190132  normal  0.953315 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2040  TonB-dependent receptor  40.89 
 
 		 787 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1702  TonB-dependent receptor  40.89 
 
 		 787 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0960904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0295  TonB-dependent receptor  35.81 
 
 		 799 aa  466  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2552  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 787 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000691451  normal  0.635758 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  37.71 
 
 		 799 aa  457  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1937  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 773 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00253489  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2292  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 773 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2936  hypothetical protein  37.52 
 
 		 550 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0884836  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1935  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 779 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000527842  normal  0.699989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2288  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 776 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2940  TonB-dependent receptor domain protein  33.05 
 
 		 244 aa  135  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00105315  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 768 aa  80.5  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 768 aa  80.5  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 778 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  23.86 
 
 		 778 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 		 738 aa  59.3  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 		 738 aa  59.3  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 730 aa  52.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 747 aa  52.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3417  TonB dependent outer membrane ferrichrome-iron receptor  23.39 
 
 		 715 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 711 aa  52  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3062  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 		 715 aa  52  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.173013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 757 aa  51.6  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 709 aa  50.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 709 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 729 aa  49.3  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 736 aa  49.3  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  21.97 
 
 		 779 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 722 aa  48.9  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 719 aa  48.5  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  20.29 
 
 		 686 aa  48.5  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  23.64 
 
 		 814 aa  48.1  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 708 aa  48.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 763 aa  48.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 789 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 821 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 777 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 758 aa  46.6  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  23.44 
 
 		 771 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 727 aa  45.8  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  25.24 
 
 		 768 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  26.87 
 
 		 627 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 777 aa  45.1  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 768 aa  44.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>