25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2940 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2940  TonB-dependent receptor domain protein  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00105315  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2552  TonB-dependent receptor  99.59 
 
 		 787 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000691451  normal  0.635758 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2935  TonB-dependent receptor  38.56 
 
 		 801 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2551  TonB-dependent receptor  38.56 
 
 		 777 aa  161  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0190132  normal  0.953315 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2040  TonB-dependent receptor  40.69 
 
 		 787 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1702  TonB-dependent receptor  40.69 
 
 		 787 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0960904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0295  TonB-dependent receptor  35.62 
 
 		 799 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2292  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 773 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1937  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 773 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00253489  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3609  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 819 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.396824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 799 aa  105  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1935  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 779 aa  91.7  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000527842  normal  0.699989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2288  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 776 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 768 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 768 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 792 aa  55.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  24.74 
 
 		 768 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 768 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  24.14 
 
 		 778 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 778 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 777 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 686 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 817 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  27.32 
 
 		 846 aa  42.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 729 aa  42  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>